核酸适配体的筛选方法学研究及靶向CD33核酸适配体偶联化合物制备方法探讨

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guodlleon
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:本课题研究内容分为两大部分。第一部分;主要探讨与优化传统核酸适配体(Aptamers)的筛选方法(如Protein-SELEX和Cell-SELEX),拟高速(high speed)筛选具有高亲和性的靶向CD33蛋白核酸适配体,并研究其结构对其亲和性与稳定性的影响。第二部分;主要以抗肿瘤药物阿霉素(Dox)及不同形态的linker为研究对象,合成核酸适配体(Aptamers)与抗肿瘤药物偶联物(ADCs),对比两种释放阿霉素(Dox)方式(即二硫键断裂和亚胺水解释放Dox)对抗肿瘤作用的影响,以确定适合用来游离目标物的结合方式。方法:第一部分,本研究以Protein-SELEX筛选为基础,主要以重组CD33抗原蛋白为靶向蛋白,筛选出与CD33特异性结合的核酸适配体(Aptamers)。其次,在Cell-SELEX筛选基础上,我们进一步优化筛选条件,缩短筛选时间和提高亲和力。研究通过以HEK-293T细胞表达CD33蛋白为CD33~+阳性细胞,HEK-293T细胞为CD33~-阴性细胞,依次优化和探索核酸适配体的筛选效率及亲和性。斑点杂交法主要用于检测筛选所得的DNA配基与CD33蛋白分子的亲和性;Western Blot及免疫荧光法用于验证细胞中CD33蛋白的表达及膜细胞定位状况;流式细胞术法检测每轮筛选后所得的DNA配基与CD33~+阳性细胞(如HL60或CD33~+过表达HEK-293T细胞)的结合能力。计算机模拟分子间对接(Docking)方法用于计算并模拟CD33蛋白与核酸适配体的三维结构。第二部分,探讨偶联药物与适配体的合成及条件摸索,解决药物与适配体之间的间接化合物SPDP (Linker)最佳反应条件;如以SPDP或SPDP-hydrazine连接抗肿瘤药物阿霉素(Dox)的反应基团酰胺键和碳氮双键,经HPLC、LC-MS和~1HNMR检测,确认Dox与SPDP~Ⅰ及SPDP~Ⅱ是否成功连接为Dox-SPDP~Ⅰ与Dox-SPDP~Ⅱ的形态;MTT与流式细胞术检测Dox-SPDP~Ⅰ 及 Dox-SPDP~Ⅱ的抗肿瘤作用,判别抗肿瘤药物Dox连接Linker。结果:第一部分,基于经典的Protein-SELEX方法,我们筛选得到能够特异性结合CD33阳性细胞的核酸适配体A88(耗时近半年)。然而,我们优化的传统核酸适配体Cell-SELEX筛选方法即Smart Cell-SELEX筛选得到核酸适配体S30(耗时9小时),并且稳定性高于经典Protein-SELEX方法筛选出的适配体,解离平衡常数Kd值均较小。流式细胞术,Western Blot和免疫荧光结果显示,Smart Cell-SELEX筛选得到核酸适配体S30特异性结合CD33阳性细胞,而且S30的进一步剪切体C2和NC2能够结合CD33抗原。第二部分:HPLC、~1HNMR和LC-MS结果显示,抗肿瘤药物Dox与Linker即SPDP~Ⅰ与SPDP~Ⅱ成功连接,形成Dox-SPDP~Ⅰ与Dox-SPDP~Ⅱ复合体。MTT与流式细胞术结果显示,Dox-SPDP~Ⅰ的抗肿瘤作用明显降低,而Dox-SPDP~Ⅱ略有降低,提示药物连接Linker会对药物本身的活性有影响。结论:第一部分:与传统筛选技术相比,新的Smart Cell-SELEX筛选技术可以将筛选时间缩短数十倍,在有效去除非特异性结合的DNA配基的基础上快速筛选出亲和性极高的核酸适配体。核酸适配体的亲和性与其结构中的特殊结构有关,但其稳定性则由整个序列决定。第二部分:与运用酰胺键连接的Dox-SPDP~Ⅰ相比,以碳氮双键偶联合成的Dox-SPDP~Ⅱ在体内更易降解并游离出Dox,且Dox糖基上的氨基可能为其活性基团。
其他文献
汽车车牌的自动识别是现代交通管理的重要研究课题之一。而车牌识别系统是现代交通运输系统的一个重要组成部分。随着现代交通环境越来越复杂,交通管理要求越来越高,把汽车车
中国民族音乐是中华民族传统文化非常重要的组成部分,随着电影业的发展,它成为了香港武侠电影中的重要元素。本文对相关电影的音乐元素进行搜集和整理,分析民族音乐元素在香
该文描述了图像压缩编码的概念,原理以及主要分类,介绍了目前常见的三种图像压缩编码方法的原理,特点以及简单讨论了其中两种方法的MATLAB代码实现。
在中国石油大庆石化公司8万t/a线型低密度聚乙烯(LLDPE)装置上试用了中国石油兰州化工研究中心80 t/a硅胶中试装置生产的LSG-1型硅胶。结果表明,用LSG-1型硅胶负载的催化剂在LL
该文通过分析武汉市地接导游的现状及存在的问题,提出“导游职业能力”的概念,通过访谈法,认为解决当前武汉市地接导游短缺的关键在于加强对导游职业能力的培养;为此构建了导游职
我国有56个民族,每个民族的生活习惯和民族特色都不尽相同,而民歌也都具有了最鲜明的文化特色。蒙古族具有悠久的历史,而蒙古族民歌更是一种独具特色的传统民族文化。蒙古民
爱德华·格里格是19世纪下半叶挪威著名作曲家、音乐家,是挪威民族乐派的代表人物之一,曾与民族音乐理论倡导者、音乐家R.诺拉克等人共同创办了"尤特皮"音乐社,从而推动挪威
该文分析了传统计算机教学模式在我国信息化人才培养过程中存在的诸多问题,比较系统的提出了校企合作的新型计算机教学模式——实训模式,并根据多年的校企合作经验,给出了一
<正>敦煌文献是晚唐五代敦煌三界寺的藏经,主要是佛教文献,占了将近百分之九十五以上,其他还有儒家经典、道家经典,以及摩尼教文献、景教文献等。特别是敦煌文书中保存的道教
会议
面临严峻的就业形势,负责毕业生就业指导的工作者,应该多方位多渠道为毕业生及时提供就业服务和指导,帮助毕业生顺利就业。让多数大学生找到一份相对满意的工作,这是就业指导