武汉地区人偏肺病毒的分子流行病学研究

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目的:人偏肺病毒是一种广泛流行于世界各地的重要呼吸道感染病原体。了解本地区人偏肺病毒的感染现状、流行特征和分型将有助于相关呼吸道感染的防控,并为临床治疗、检测试剂开发和疫苗的研发提供理论依据。本研究的目的是对武汉地区的门诊流感样病例患者进行人偏肺病毒的检测和分子流行病学调查,了解本地各年龄阶段人群的感染现状及病毒流行规律。方法:2008年7月至2011年12月,武汉市儿童医院和武汉市一医院门诊共收集到4009例符合纳入标准的流感样病例患者。使用实时荧光RT-PCR方法检测患者咽拭标本中的人偏肺病毒RNA,使用RT-PCR方法对人偏肺病毒阳性样本的部分N基因和F基因片段进行扩增和测序,测序结果用于基因分型和系统发生分析。此外,结合患者信息对武汉地区的人偏肺病毒感染人群时间分布进行统计分析。结果:在4009份流感样病例标本中共发现117例人偏肺病毒RNA阳性标本,检出率为2.92%,其中15例还存在其它呼吸道病毒感染,混合感染率为12.8%。各年龄组患者中以5岁及以下儿童的人偏肺病毒感染率最高(5.34%),6-15岁儿童和16-64岁成人的感染率分别为0.82%和0.31%,84例65岁以上老年流感样病例患者中未检出人偏肺病毒阳性。研究期间,武汉地区的人偏肺病毒感染表现出以两年为周期的季节分布模式,在08年10月至09年3月以及2010年3至6月两次达到流行高峰,高峰期人偏肺病毒检出率分别为19.44%和24.76%。117份阳性样本中的102份分型成功,其中36份为A2亚型(30.8%)、41份为B1亚型(35.0%)、25份为B2亚型(21.4%)。本研究未发现A1亚型,且所有A2亚型阳性样本均属于A2b群。A型和B型人偏肺病毒同时流行于研究过程中的各个年度,但每个流行季节只有一型占据优势:08/09年度的优势型是A型,而09/10、10/11以及11年下半年的优势型为B型,其间发生了一次优势转换。系统发生分析证明武汉地区流行的人偏肺病毒毒株与参考毒株在进化上十分接近,但武汉流行株也表现出了基因变异和遗传分化的迹象。结论:本研究是国内首次对一个地区的全年龄段人群进行为期1年以上的大型人偏肺病毒流行病学调查。研究证明人偏肺病毒是引起武汉地区儿童急性呼吸道感染的一个重要病因,且在成人中也有传播;本地人偏肺病毒感染的高发人群是5岁以下儿童;A型和B型人偏肺病毒在武汉地区同时流行,优势相互交替。我们的研究结果对本地区人偏肺病毒感染的预防和治疗具有积极的指导意义。
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