亚太经合组织（以下简称APEC）与东盟（ASEAN）的双边关系的发展是新世纪的APEC面临的极为重要的挑战之一。东盟与亚太经合组织的双边关系可以追溯到冷战末期，在冷战结束后的90年代初期，由于亚太经济圈的繁荣，双方的关系处于良性阶段。在东南亚金融危机爆发后，APEC面对东南亚国家的危机无能为力，同时APEC中的西方大国企图利用APEC这样一个纯粹的区域经济组织来达到自己的政治目的，一系列原因导致了东盟与APEC关系的倒退，使人们对新世纪两大组织双边关系的发展在充满了希望的同时也产生了忧虑。本文从双边关系的历史进程入手，根据双边关系的动态发展，分阶段地阐述了两大组织关系的演变和发展，然后将两大组织看成一对变量，将其他因素（经济因素、大国因素、区域性组织因素）看成常量，通过不同因素的影响来考察判断两大组织双边关系的现状，并据此推出三种模式来分析东盟与APEC关系的前景，由此也为中国如何利用这种双边关系来发展和强化自身的实力提出对策。