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小鹅瘟是由小鹅瘟病毒(Goose Parvovirus,GPV)引起3~20日龄雏鹅和雏番鸭的一种急性或亚急性败血性传染病,具有传播快、发病率高和死亡率高等特点,给养鹅业造成了重大损失。为研究小鹅瘟在广东省的流行情况,在2015年9月至2016年12月,从广东省各地采集到有疑似小鹅瘟症状的鹅肝脏与肠组织42份,共分离到7株GPV,分别是从粤北地区清远市分离到的QY1和QY2,从珠三角地区广州市分离到的GZ1和GZ2,从粤西地区阳江市分离到YJ1和YJ2,从粤西地区茂名市分离到的MM。对这7株GPV全基因进行测序,并对其序列、遗传进化和糖基化位点进行分析。结果显示如下:在全基因分析中,7株GPV的全长都为5050 bp,它们之间的同源性为99.8%~99.9%,在进化树中形成一个独立的新分支。7株GPV与GenBank上已发表的全基因序列同源性为93.4%~98.9%,与重庆毒株RC16亲缘关系最近,同源性为98.8%~98.9%;与标准株B同源性为98.2%~98.3%。对NS进行分析发现,7株GPV的NS1和NS2分别长为1884 bp和456 bp,分别可翻译成628和152个氨基酸。7株GPV的NS1的同源性为99.7%~100%,而NS2的同源性为100%。NS1只有个别碱基发生突变并引起氨基酸的变化,而NS2没有发生碱基的突变。7株GPV在NS1进化树中形成一个独立的新分支,与台湾毒株06-0329、82-0321以及重庆毒株RC16亲缘关系最为接近,同源性为99.1%~99.7%;与标准株B同源性为99.0%~99.2%。在NS2进化树中形成一个独立的新分支,与台湾毒株上海毒株SHFX1201和重庆毒株RC16亲缘关系最为接近,同源性为99.1%~99.6%;与标准株B同源性为98.7%。7株GPV的NS有着4个相同的糖基化位点,分别为150-152NKT、225-227NYS、360-362NWT、433-435NST,而GZ2比对比其他毒株多了330-332NAT糖基化位点。对VP进行分析发现,7株GPV的VP1、VP2和VP3分别长为2199 bp、1764 bp和1605 bp,分别可翻译成733、588和535个氨基酸。VP1、VP2和VP3同源性分别为99.6%~100%、99.6%~99.9%和99.6%~99.9%。7株GPV在VP1进化树中形成一个独立的新分支,与广东毒株GDFSh以及重庆毒株RC16亲缘关系最为接近,同源性为97.7%~98.2%;与标准株B同源性为97.4%~97.5%。在VP2进化树中形成一个独立的新分支,与标准株B同源性为97.8%~97.9%。在VP3进化树中与江苏毒株JSXZ-4和安徽毒株AH-1形成一个独立的新分支,亲缘关系最近,同源性为98.8%~99.8%;与标准株B同源性为97.9%~98.0%。7株GPV的VP有着5个相同的糖基化位点,分别为219-221NAS、331-333NLT、582-584NTT、700-702NFS、712-714NET。对ITR进行分析发现,7株GPV的ITR都长为416 bp,它们间的同源性为99.8%~100%。7株GPV在进化树中形成一个独立的新分支,与重庆毒株RC16和台湾毒株06-0329亲缘关系最近,同源性为97.0%~98.9%;与标准株B同源性为88.8%。本研究通过对从广东分离到的7株GPV基因序列、遗传进化和糖基化位点进行分析,旨在了解小鹅瘟病毒在广东省的进化方向和变异程度,为广东小鹅瘟的防控提供数据依据。