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肾细胞癌被认为是泌尿系统发病率极高的恶性肿瘤,而肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)是肾脏恶性肿瘤最常见的亚型。尽管肾透明细胞癌的治疗方法已取得很大进展,但其死亡率仍非常高,尤其是对于晚期/转移性肾透明细胞癌的患者,目前免疫疗法和分子靶向药物的疗效并不理想。癌症相关的异常可变剪接分析是近年来癌症靶标搜索的重要研究方向。可变剪接造成异常蛋白的产生或过度表达,这些蛋白调控细胞周期、细胞凋亡等生命过程,从而导致癌症的发生和发展,但目前缺乏关于可变剪接对肾透明细胞癌影响的全面分析。因此为了改善肾透明细胞癌患者的治疗效果,进一步完善用于肾透明细胞癌患者的预后预测和治疗的生物标志物,以供潜在的诊断性治疗靶点筛选以KIRC治疗,本论文针对与KIRC相关的可变剪接同工型并对其功能作用进行了深入探究,主要分为以下三个方面的内容。首先,为筛选KIRC中癌旁与癌症样本之间差异可变剪接事件(Different alternative splicing events,DASEs),本论文基于TCGA提供的RNA-Seq数据将252个样本纳入本次研究队列,在该研究队列中共检测604个DASEs,其中大多数与可变剪接相关的基因会产生两种以上的可变剪接同工型。其次,为了研究DASEs的潜在功能,探索其在KIRC发生与发展过程中的影响,本论文通过GO富集分析、肿瘤免疫浸润分析、剪接因子相关分析、生存分析对DASEs的功能进行全面分析,揭示了DASEs亲本基因在与KIRC和癌细胞转移有关的途径中显着富集,构建了剪接因子相关调控网络,发现在细胞迁移中起作用的RASGEF1A基因发生AP后产生的同工型与KIRC中浸润性T淋巴细胞的占比显著相关,此外本论文筛选与KIRC患者生存时间显著相关的40个DASEs。最后,为进一步分析KIRC中可变剪接对癌细胞转移的影响,本论文首次结合PCBC数据库提供的干细胞RNA-Seq数据,基于一类逻辑回归算法建立了KIRC干性指数(m RNA stemness index,m RNAsi)预测模型,从一个全新的角度揭示可变剪接在不同去分化程度的KIRC样本中的潜在调控机制。本论文以TCGA提供的KIRC样本为研究对象,识别了在KIRC中的差异可变剪接事件,对与KIRC相关的可变剪接事件进行全面分析,并筛选到与KIRC免疫微环境、KIRC患者生存时间以及KIRC患者的干性指数显著相关的DASEs。本论文有助于研究可变剪接在KIRC发生过程中的机制,为鉴定潜在的临床生物标志和治疗靶标提供参考,具有重要的理论意义和应用价值。