随着社会主义市场政治与经济的发展，我国的政府审计不断适应新的形势，不断满足广大社会公众对政府审计的监督需求。但是在每年的政府审计中，审计质量依然不尽如人意，这使得我国政府审计的发展面临着瓶颈。刘家义审计长顺应时代的潮流，提出了政府审计的“免疫系统”理论。本文从“免疫系统”的角度来研究政府审计质量。政府审计质量分为“过程审计质量和结果审计质量”，在实际研究中，有些学者以结果审计质量的数据来论证政府审计质量。审计界对“免疫系统”进行了生动的分析，认为“免疫系统”是政府审计的本质。本文依据免疫系统理论、信号传递理论和审计期望差距等理论，分析论证我国的政府审计质量，然后构建“免疫系统”模型，利用2005-2011年我国各地方审计情况的相关数据，运用实证分析的方法，检验免疫系统是如何影响我国政府审计质量的。描述性分析发现东部政府审计问题是“雷声大雨点小”，中部与我国整体发展状况趋同；西部是群众意识很高但是相关的配套措施跟不上等等。线性回归模型的研究发现，当年的“防御”和“监视”效果会对下一年的“防御”和“监视”效力产生积极影响，当年的“防御”和“监视”效力也会对下一年的“防御”和“监视”效力产生积极影响。最后的调查问卷从社会公众的角度论证了这一观点的合理性，但是审计期望差距的存在仍然会影响对政府审计质量的评价结果。最后对本文的结论进行总结，并针对本文中的不足对未来的研究进行展望。本文将“免疫系统”运用于政府审计中，运用实证分析的方法对政府审计质量进行量化的研究，其中不仅考虑了审计界的观点，还考虑到社会公众的审计期望，这是本文的创新所在。