十字花科黑腐病菌中GGDEF结构域蛋白基因XC0831的功能研究

来源 :广西大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:VictorXie
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
GGDEF结构域因其活性中心保守的Gly-Gly-Asp-Glu-Phe氨基酸残基序列而得名。多数具有GGDEF结构域的蛋白都具有二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase, DGC)活性,催化两分子GTP合成环二鸟苷单磷酸(cyclic di-GMP, c-di-GMP).第二信使c-di-GMP在很多细菌特别是病原菌中参与调控多种受群体感应(quorum sensing, QS)调控的细胞反应。十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pathvar campestris, Xcc)是十字花科植物黑腐病的病原菌,是研究微生物与寄主相互作用分子机理的模式菌株之一。.Xcc8004中有32个基因编码含GGDEF结构域蛋白,部分GGDEF结构域蛋白与Xcc致病性、胞外酶产生、生物膜形成和运动能力等相关。XC0831是Xcc8004中编码含GGDEF结构域蛋白的第二大基因。在先前的工作中,本实验室已构建出XC0831的非极性整合突变体NK0831和Tn5插入突变体,两者致病力与野生型相比均明显下降,但其他表型如生物膜、絮凝、游动性等有较大差异。为了更准确的分析该基因的功能,本研究构建了XC0831的缺失突变体DM0831和结构域缺失突变体:DMSP、DMGGDEF。实验结果显示,DM0831突变体的致病力和运动能力较野生型Xcc8004明显下降,且胞外蛋白酶产量升高,在MMX培养基中生长速度降低,吸附能力增强。DMSP仅胞外纤维素酶产量降低,DMGGDEF的胞外蛋白酶产量高于野生型。本研究构建了DM0831的反式功能互补菌株和过表达菌株(分别采用pLAFR6和pLAFR3两种不同质粒)。在DM0831中导入含有不同结构域(标记为A、C、D)的片段的pLAFR3质粒,根据表型分析对应结构域的功能。DM0831中导入pL6-0831质粒后其多种生理生化表型基本得到恢复,如蛋白酶产量降低、运动能力增强、吸附能力减弱至野生型状态,但未恢复DM0831的致病力。NK0831、WT8004/pL3-0831、DM0831/pL3-0831的致病力均降低,其中DM0831/pL3-0831的致病力仅为野生型8004菌株致病力的5%左右。另外,三种菌株的胞外淀粉酶、胞外纤维素酶、EPS产量和运动能力降低,但其胞外蛋白酶产量和吸附能力升高,在LB培养基中摇瓶培养可以产生絮凝,这与胞内c-di-GMP水平高于正常水平时的表型一致。以此推测XC0831的过表达菌株胞内c-di-GMP水平提高。与DM0831相比,DM0831/pL3-A运动能力提高,而DM0831/pL3-C的运动能力降低,且两者在LB培养基中摇瓶培养均产生絮凝。DM0831/pL3-D较DM0831在各表型上均无明显变化。对比分析DM2252和Xcc8004的转录组结果,发现在MMX培养基中,XC2252对XC0831的表达有负调控作用。本研究构建了XC0831基因表达GUS报告子并分别导入WT8004和DM2252,定量检测GUS活性发现在DM2252中XC0831的表达量高于其在Xcc8004中的表达,这与转录组结果基本相符。另构建了DM2252/DM0831双缺失突变体,DM2252在LB培养基中摇瓶培养情况下可以产生絮凝,而DM2252/DM0831不能产生絮凝。说明DM2252可以产生絮凝可能是由于其菌株内XC0831的表达量增加起到主要作用。本研究通过对XC0831各功能区域的功能鉴定和分析,和vemR对其调控关系的鉴定与分析,研究其调控生物膜形成的机制,为更好的解释细菌调控生物膜形成与解离的机制提供更多证据。
其他文献
广播媒体要主动把握市场脉搏,择机融合新兴媒体,以“我”为主的呈现,才能在这种融合中确立广播作为一个主体的市场地位。在当今面对新兴媒体风起云涌、席卷而来之势,对基本还
  V型N5+是第三个具有宏观量级的全氮结构。它最初是通过HN3与N2F+反应合成[1]。后来发现HN3与NF2O+也能通过类似的反应合成出N4FO+ [2]。加入过量的HN3后,实验上并没有观测
会议
组蛋白修饰是表观调控的重要分子基础。其中以组蛋白的甲基化和乙酰化最为常见。组蛋白去乙酰化酶主要有HD2、Silent information regulation2(SIR2)、Reduce Potassium Dependency3(RPD3)三个亚家族。SIR2亚家族的基因可以维持异染色质的稳定,参与DNA修复,肿瘤形成,抑制脂肪组织的过度累积等生长发育过程。组蛋白去甲基化酶主要有Lysine
  2013年,吉非替尼(易瑞沙)成为第一个被FDA批准上市用于治疗晚期非小细胞肺癌(NSCLC)的靶向药物[1-2],其化学分子结构见Fig.1.核磁共振技术(NMR)是结构分析的重要手段,已
会议
VO_2是一种具有热致相变性能的金属氧化物,其相变温度为68℃,相变时VO_2在单斜金红石结构与四方金红石结构之间发生转变,同时其电学、光学性能也发生突变。为了使VO_2材料更好的应用于“智能窗”领域,本文以优化制备工艺参数、降低VO_2相变温度、提高薄膜透光率作为研究重点。研究结果表明:以V_2O_5粉末为反应原料配制溶胶,溶胶最佳浓度为30g/L,添加阿拉伯树胶为分散剂,以浸渍提拉法镀制薄膜,
  蛋白质变性是指在某些物理(热、压强等)和化学因素(尿素(urea)、盐酸胍(GdmCl)等)作用下其特定的空间构象被改变,从而导致其物理化学性质的改变和生物活性的丧失的过程.以
会议
  Mg(3s3p1P1)和H2反应生成的MgH分子具有两个相似的特征转动吸收峰,分别对应高转动态和低转动态,虽然实验上借助同位素分析法可以很好的解释其高转动态产生的原因,但对于
会议
  Zn掺杂Cu2(OH)2CO3制备的(Cu1-xZnx)2(OH)2CO3是Cu/ZnO催化剂重要的前驱体之一.目前文献报道Zn最大的取代量为x≈0.27[1],难以进一步提高,且对Zn取代量上限的理论原因及Z
会议
  SiO+在星际云层中的化学反应中起到了重要的作用。我们计算得到了SiO+的21个Λ-S态的势能曲线并将部分束缚态的光谱常数以及辐射寿命与实验值进行了比较。得到的X2Σ+,A2
在国家进步与社会发展的背景下,中国的国际化发展水平逐步提高,也开始有大量的外国语言与文化进入到我国.英语教育在我国占据重要地位,从基础教育阶段开始就在学校教育当中进
期刊