广西是我国最大的甘蔗种植区，干旱和长期单一连作引致土壤退化，已成为制约甘蔗产业发展的主要问题之一。丛枝菌根（Arbuscular mycorrhizas，AM）真菌能促进宿主对水分和养分（特别是磷）的吸收和利用，促进土壤生态系统的良性循环。本研究在我们对广西甘蔗根际土壤AM真菌初步调查的基础上，系统采集广西主要甘蔗种植区不同土壤类型的甘蔗根系和根际土壤，通过分子生物学辅助技术，鉴定AM真菌种类，以了解不同土壤类型AM真菌的侵染特点，揭示广西甘蔗根际土壤AM真菌多样性、优势种群及分布特点，以及探究土壤理化性质对AM真菌多样性的影响，为进一步利用AM真菌提高甘蔗抗逆性和土壤养分的利用率提供理论依据。主要结果如下:　　1.本研究共采集了26个市（县/区），包含7种不同土壤类型的甘蔗根系和根际土壤作为研究对象，获得52份根系、52份土壤。测定了土壤pH值、有机质、总氮、有效磷和交换性Mg2+。研究表明，广西甘蔗土壤酸化严重，pH6.0以下的占61.5％，其中pH4.0以下的占5.8％，pH4.0-5.0占28.8％，pH5.0-6.0占26.9％。pH6.0-7.0占25％，pH7.0以上的占13.5％。有机质、氮含量等土壤营养物质含量偏低。除了有效磷，其余各项土壤理化性质的最高值均为石灰土，而最低值均为砖红壤。　　2.甘蔗属于菌根型作物。研究表明，甘蔗根系均能与AM真菌形成互惠共生体。经Pearson相关性分析结果表明，根上菌丝与根内菌丝侵染率(R=0.558，P=0.00)、与泡囊的侵染率（R=0.588，P=0.00）呈极显著正相关。根内菌丝侵染率与泡囊侵染率(R=0.435，P=0.001)呈极显著正相关。　　3.甘蔗根系菌根侵染率受到土壤理化性质的影响。pH值(R=0.367，P=0.007)、有效磷（R=-0.609，P=0.000）与根内菌丝侵染率呈极显著负相关。土壤理化性质对甘蔗根系侵染率的影响因土壤类型不同而存在差异。在赤红壤中，有机质(R=-0.478，P=0.028)、总N(R=-0.541，P=0.011)和有效P(R=-0.709，P=0.00)与根内菌丝侵染率呈显著负相关。在砖红壤中，总N与根内菌丝侵染率(R=-0.823，P=0.044)呈显著负相关;有效P和根内菌丝侵染率（R=-0.926，P=0.008）呈极显著负相关。在红壤中，pH值与根内菌丝侵染率(R=0.924，P=0.008)呈极显著正相关;有机质(R=-0.865, P=0.026)、总N(R=-0.860, P=0.028)、有效P(R=-0.877, P=0.022)与根内菌丝侵染率均呈显著负相关。　　4.本研究采用Nested-PCR扩增AM真菌18S rDNA目的片段，对广西主要甘蔗种植区甘蔗根系和根际土壤样品AM真菌克隆文库进行分子多样性分析。以97％的阈值划分操作分类单元(OTU)，将所得到的AM真菌序列划分为32个OTU，通过聚类分析划分为7科13属32种AM真菌。分别为球囊霉科(Glomeraceae)有5属17种;多样孢囊霉科(Diversisporaceae)有2属3个种;无梗囊霉科(Acaulosporaceae)1属1个种;巨孢囊霉科(Gigasporaceae)有2属2个种;Claroideoglomeraceae科有1属5个种;原囊霉科(Archaeosporaceae)有1属2个种;类球囊霉科(Paraglomaceae)有1属2个种。在32个分子种中，有7个分子种和已知种聚在一起。所有土壤类型均以球囊霉科为主，其次为Claroideoglomeraceae科和类球囊霉科，其他科在所有样地均比较稀有。所以球囊霉科为7种土壤类型的优势科;Rhizophagus属为优势属。　　5.不同土壤类型的AM真菌多样性。赤红壤发现7科11属22种，砖红壤发现5科7属11种，红壤发现4科8属12种，石灰土发现4科8属14种，其他类型土壤发现5科9属12种。在不同的土壤类型中，根系及根际土壤AM真菌的丰富度和香农维纳指数最高值均为红壤。不同土壤类型的AM真菌物种丰富度、香农维纳指数不存在显著性差异。　　6.经Pearson相关性分析表明，在砖红壤、红壤、石灰土以及其他类型的土壤中，土壤理化性质与AM真菌物种丰富度没有显著的相关性;在赤红壤中，土壤的pH值与根系AM真菌的物种丰富度呈显著负相关(R=-0.474，P=0.03)，交换性Mg2+与根系AM真菌的物种丰富度呈极显著负相关(R=-0.583，P=0.006)。　　7.对AM真菌分子种进行群落排序发现，根部和根际土壤的AM真菌的群落分布差异较显著。虽然不同类型的根际土壤中，AM真菌的群落结构差异不明显，但在赤红壤和石灰土的甘蔗根系中，AM真菌群落结构分布差异比较明显。此外，将群落排序和环境因子拟合，发现甘蔗根际土壤AM真菌的群落分布与土壤理化性质之间并不存在关系。