血管紧张素转化酶(ACE)抑制剂是目前用于预防治疗高血压的重要药物之一。二肽和三肽作为ACE抑制肽(ACEIP)能被消化道直接吸收并对正常人没有降压作用。本文借助QSAR和分子对接等计算机辅助药物设计的方法从二肽和三肽库中筛选ACE抑制活性较高的降血压肽,并以虚拟筛选结果为基础做进一步的实验验证。取得结果如下:　　 (1)QSAR搜集二肽171个,三肽147个,分别用3-z标度(3-z scale)和5-z标度(5-z scale)两种方法对ACE抑制肽的序列和活性之间的关系进行研究。结果表明,3-z标度和5-z标度两种模型预测结果基本具有一致性,二肽3-z标度模型去除奇异点后累积解释Y变异平方和(R2Y)和预测能力(Q2)分别为:75.8％和72.4％,5-z标度为77.1％和73.1％,三肽3-z标度结果为47.2％和42.5％,5-z标度为44.2％和36.5％。用图表的形式表示了各个位置上个氨基酸对ACE抑制活性的贡献大小,结果表明:二肽和三肽的3-z、5-z标度结果相似,二肽处于氨基端的氨基酸残基(n1)为W、F、I、L、M,处于羧基端的氨基酸残基(n2)为W、F、Y时,活性较高;三肽处于氨基端的氨基酸残基(n1)为I、L、V,中间端氨基酸残基(n2)为R、K,羧基端的氨基酸残基(n3)为W、F、Y、P时,活性较高。　　 (2)分子对接从ACE的晶体结构出发,借助SYBYLS.0中Legion模块分别构建二肽和三肽的组合库,并用Surflex-Dock模块和Discovery Studio2.1中的CDOCKER模块进行分子对接,筛选活性较高的降血压肽。对接结果表明,二肽对接打分与logIC50之间存在一定的线性关系(R2=0.233),而三肽结果的相关系数较低,几乎不能找出其相关性。以对接结果为基础,用Discovery Studio2.1的Score Ligand Poses模块进行了重新打分,然后用Consensus Score模块进行打分一致性评测。以一致性评测的结果为基础,选取总体样本中前20％的分子对其氨基酸组成进行分析。结果表明:基于Surflex-dock的对接结果中,二肽N端氨基酸(n1)为H、R、F、W、Y,C端(n2)为W、H、E、L、K时对接结果较好;三肽N端氨基酸(n1)为W、E、F、Y、H,中间端氨基酸(n2)为W、F、K、Y,C端氨基酸(n3)为H、F、W、Y时对接结果较好。基于CDOCKER的对接结果中,二肽N端氨基酸(n1)为D、E、F、Y、W,C端(n2)为R、H、K、T、Y、W时对接结果较好;三肽N端氨基酸(n1)为W、Y、R、F、P,中间端氨基酸(n2)为W、K、R、Y,C端氨基酸(n3)为H、R、K、W、Y时对接结果较好。这与Z标度法的结果相差较大。　　 (3)实验验证以Z标度和分子对接的虚拟筛选结果为基础,固相合成4条二肽:WW、WY、IW、WH;5条三肽:IRW、IKY、WWD、LRF、IKW,从新鲜兔肺中提取分离ACE酶,以FAPGG为底物,测定各合成肽的logIC50值。结果如下:二肽WW logIC50为1.544;WY为1.903;IW为0.699:WH为2;的三肽IRW logIC50为0.477;LRF为1.176;IKW为0;IKY为0.699,WWD未能检测到ACE抑制活性。　　 实验结果表明,合成肽的抑制活性与Z标度法的结果契合度较大,与分子对接的结果契合度较小。从本实验结果来说,活性肽类物质的筛选中,与分子对接的方法相比,Z标度法具有更好的预测作用。