食管鳞癌中RUNX3基因启动子高甲基化及其表达失活的实验研究

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食管癌是我国常见的恶性肿瘤之一,占恶性肿瘤发病率的第6位,死亡率为第4位,在亚洲国家中食管鳞癌占90%。目前,对食管癌的癌变机制研究取得了一定的进展,但具体分子机理仍不清楚。近年来研究发现某些肿瘤抑制基因其DNA序列完整,并未有突变、缺失等变化,用经典的遗传调控理论难以解释抑癌基因失活的现象,逐渐认识到Epigentics(表观遗传学)参与肿瘤的发生和发展,主要包括DNA甲基化和组蛋白去乙酰化,其中DNA甲基化是表观遗传调控的重要方式。近年来研究遍认为DNA甲基化是肿瘤抑制基因失活的主要原因,是抑癌基因失活的第三条途径,在某些情况下甚至可能为调控基因转录的唯一的机制。最近研究发现RUNX3是一个新的候选抑癌基因,在人类肿瘤细胞系或肿瘤组织如胃癌、肝癌、胰腺癌、肺癌、结肠癌中表达下调或缺失,而RUNX3基因启动子区高甲基化是导致RUNX3表达失活的主要原因之一,但在食管鳞癌中RUNX3基因启动子甲基化及其转录表达状况国内外尚无文献报道。从比较基因组学研究来看,食管鳞癌存在1p36.1位点的高频率杂合性缺失(LOH),由于RUNX3基因正好位于1p36.1位点,因此食管鳞癌的发生发展很可能涉及到RUNX3基因的表达改变。为此,我们第一部分运用半定量RT-PCR、Western blotting方法分别从mRNA及蛋白水平检测RUNX3基因在食管鳞癌中表达情况,并分析其与临床病理参数的关系,评判RUNX3基因是否是食管鳞癌的候选抑癌基因;第二部分首先运用MSP技术从DNA水平检测RUNX3基因启动子甲基化状况,探讨RUNX3基因在食管鳞癌中表达失活的可能机制;然后采用甲基转移酶抑制剂5-氮杂胞苷(5-azaC)对食管鳞癌Eca109细胞株进行干预,探讨5-azaC对Eca109细胞株生长增殖及其RUNX3基因表达的影响,以期进一步探讨食管鳞癌中RUNX3基因表达失活的机制并寻找肿瘤治疗的新靶点。第一部分食管鳞癌中RUNX3基因表达失活及临床意义的研究目的:探讨RUNX3在食管鳞癌中的表达情况及其与临床病理参数的关系,评判RUNX3基因是否是食管鳞癌的候选抑癌基因。方法:采用半定量RT-PCR、Western blotting方法分别从mRNA及蛋白水平检测RUNX3基因在Eca109细胞株、42例食管鳞癌组织及癌旁正常组织中表达的差异、并分析其与临床病理参数的关系等。结果:RT-PCR显示RUNX3 mRNA在Eca109细胞株中表达缺失,在54.8%(23/42)的食管鳞癌组织中表达缺失或明显下调,而在42例癌旁正常组织中正常表达,RUNX3 mRNA在癌组织与癌旁正常组织中的转录表达存在显著统计学差异(P<0.001)。RUNX3 mRNA的表达缺失或下调与食管鳞癌淋巴结转移、TNM分期密切相关(p值均小于0.05),与性别、年龄、肿瘤大小、分化程度、饮酒史、家族史等之间无明显相关(P>0.05)。Western blotting显示Eca109细胞株及47.6%(20/42)食管鳞癌组织RUNX3蛋白表达明显下调或缺失,而在癌旁正常组织中表达正常,RUNX3蛋白在癌组织与癌旁正常组织中的表达有显著统计学差异(P<0.001),RUNX3蛋白的表达下调或缺失与淋巴结转移、TNM分期显著相关(P值均小于0.05),与性别、年龄、肿瘤大小、分化程度、饮酒史、家族史等之间无明显相关(P>0.05)。结论:RUNX3基因在食管鳞癌组织及细胞株Eca109中存在明显的表达缺失或下调,并与食管鳞癌TNM分期及淋巴结转移密切相关,RUNX3是食管鳞癌的新型候选抑癌基因。第二部分食管鳞癌中RUNX3基因启动子高甲基化及其去甲基化干预研究第一节食管鳞癌中RUNX3基因启动子高甲基化及临床意义的研究目的:检测RUNX3基因启动子甲基化状况,探讨RUNX3基因在食管鳞癌中表达失活的可能机制。方法:采用MSP技术检测42例食管鳞癌、癌旁正常组织及细胞株Eca109中RUNX3基因启动子区甲基化状况,并分析其与临床病理参数之间的关系。结果:MSP表明64.3%(27/42)的食管鳞癌组织及Eca109细胞株中存在RUNX3启动子区高甲基化,而相应癌旁正常组织未见高甲基化,RUNX3启动子甲基化率在癌及癌旁正常组织比较中有显著统计学差异(P<0.001),RUNX3启动子高甲基化与淋巴结转移、TNM分期密切相关(P值分别小于0.05和0.01)。无淋巴结转移(N0)组RUNX3启动子甲基化率为43.8%,而淋巴结转移(N1)组为76.9%,二者相比有显著统计学差异性(P=0.029)。食管鳞癌TNM分期早期(Ⅰ~Ⅱ期)RUNX3启动子甲基化率为38.9%,晚期(Ⅲ~Ⅳ期)为83.3%,二者相比有显著统计学差异(P=0.008)。27例RUNX3基因启动子高甲基化食管鳞癌组织中有23例其mRNA表达缺失或降低,20例RUNX3蛋白表达下调,RUNX3启动子高甲基化与mRNA及蛋白表达呈显著负相关(r=-0.82和-0.711,P<0.001)。结论:RUNX3基因启动子高甲基化是RUNX3表达失活的主要原因,在食管鳞癌的发生发展中起重要作用,RUNX3基因启动子甲基化检测可作为食管鳞癌预后评估的肿瘤标志物。第二节5-氮杂胞苷对Eca109细胞株生长增殖及其RUNX3基因表达影响的研究目的:探讨5-azaC干预对Eca109细胞株生长增殖及其抑癌基因RUNX3表达的影响,以期进一步探讨食管鳞癌中RUNX3基因表达失活的机制并寻找肿瘤治疗的新靶点。方法:应用MTT法来观察5-azaC对Eca109细胞生长增殖的抑制能力,摸索有效细胞干预浓度;采用10μmol/L,20μmol/L,50μmol/L三种不同浓度的5-azaC处理Eca109细胞株,采用MSP检测干预前后Eca109细胞中RUNX3基因启动子区的甲基化状况;应用RT-PCR,Western blotting等方法检测干预前后Eca109细胞中RUNX3基因的mRNA和蛋白表达水平的变化;流式细胞仪检测干预前后细胞凋亡的变化。结果:Eca109细胞RUNX3基因启动子处于异常的高甲基化状态,经5-azaC处理后,高甲基化的RUNX3基因启动子部分去甲基化;处理前启动子高甲基化的RUNX3基因其mRNA或蛋白均不表达,去甲基化处理后能重新激活该基因表达,并呈一定的量效依赖关系;经三种不同浓度5-azaC处理后,Eca109细胞生长增殖减慢,凋亡率明显增加。结论:5-azaC能重新激活Eca109细胞中RUNX3基因mRNA的转录和增强蛋白表达,在一定范围内呈量效依赖关系,并能抑制细胞生长增殖,诱导细胞凋亡。
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