在我国正在进行的机构改革中,很多事业单位科研机构已被重组转制为企业,或者正在改革的转企进程中。无论对正在转企中的科研事业单位，或是已经转企成功的科研机构,薪酬制度改革作为机构改革的一个重要组成部分显得更加紧迫。国内外企业薪酬管理系统中,为提高职工工作热情和工作效率，很早就采用了绩效与岗位管理模式,这也正是企业发展众多管理方法中重要组成部分之一。许多公司最先把绩效与岗位管理归入人力资源管理系统,这是一种效果显著的管理人力资源的方式。今天的绩效与岗位管理已经发展成为一套更为成熟的管理系统、框架系统与技术系统。科研事业单位在转企过程中可以参考借鉴较为成熟的企业薪酬管理系统，结合单位自身特点和实际情况，建立符合单位特色且可行性较高的薪酬管理方法。本文研究的主题是事业单位科研机构转企换后的薪酬管理体制改革,研究怎样从薪酬福利的角度出发，促进并激励转企后科研工作者的工作创新性、积极性,使科学研究机构转企后迅速适应市场,参与激烈地市场竞争。在这个问题上,本文通过对薪酬福利管理各基本要素的分析,和对薪酬管理体系的各种要素之间的关系进行解析,给出事业单位中科研机构转企后，薪酬福利体制改革的核心是绩效、岗位管理。选择NY单位为例,本文基于转企后的科研机构的内部管理系统,在现代科学研究机构的管理系统中引入绩效薪酬系统管理的相关的概念，探索如何有效地进行绩效管理和岗位价值评价,通过分析NY单位目前的薪酬管理体制中存在的问题,建立一套改进薪酬管理体制的实施方案,为转企后的NY单位实现现代科研院所建设提供保障,希望对行业內及其他有关单位薪酬管理的改进工作做必要的探索。同时,也可以为其他准备转企或正在转企的事业单位科研机构提供薪酬福利制度体系改革参考。