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随着中国经济总量的增加,能源、环境、生态等问题日趋严峻,实现经济社会可持续发展需要增长方式的转变。无论是国家、区域还是产业都渴望通过科技创新资源投入的加强,以提升创新能力。迄今为止,有关科技资源投入与经济增长关系的研究已经很多,特别是新增长理论产生以后,许多研究者依据全要素生产率(TFP)方法分析经济增长的来源,以此判断经济增长模式的可持续性。但是这些研究常常把不同类型的科技资源作为一个整体,未能区分不同来源科技投入经济绩效的差异。本研究在分析基于来源的中国区域科技创新资源投入的总量、强度和结构特征的基础上,比较它们所产生的经济绩效,探求引致绩效差异的原因,提出相应的对策。沿用新增长理论分析科技投入经济绩效问题的一般方法,论文使用1997~2008年中国省级区域面板数据,对现有文献做三个方面的拓展:第一,将S&T投入区别为来自政府的投入和来自企业的投入;第二,选择区域之间的技术成交额作为计量S&T投入外溢的尺度,并将其与不同类型科技创新投入置于同一框架下,应用面板回归分析方法,比较它们对TFP的作用;第三,在TFP测度中,选择数据包络分析(DEA)法,剔除了传统“索罗余值”法计算中的非创新冗余,同时又将TFP分解为技术效率(EC)和技术进步率(TC)两个部分。通过分析,论文得出以下结论:(1)12年来中国东、中、西部三个地区科技创新投入都有快速增长,其中东部地区增长更快,这主要是由于东部地区企业科技投入的增加远远超过中西部地区。尽管不同科技投入全国范围内发散,但在各自区域内部分存在收敛趋势。(2)中国TFP增长主要来自于科技进步率(TC)的贡献,技术效率(EC)对TFP的增长不仅没有贡献,反而起到相反的作用。从地区情况看,东部地区TFP增长明显,中西部地区TFP并没有显著的增长。(3)不同类型的S&T活动对TFP影响的程度和方向不同:企业S&T投入对TFP作用效果最大,且对于东部地区TFP的作用大于中部和西部;创新溢出(技术交易)带来的TFP效应居其次,且对西部地区TFP的作用大于中部,对中部地区的作用大于东部;而政府S&T投入的TFP弹性在三个地区均为负值。(4)提高科技创新投入经济绩效需要提高知识产出水平,政府科技投入知识产出弹性大于企业的科技投入。加强科技创新主体间的合作将能够带来知识产出的增加。