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研究背景:银屑病(psoriasis)是由多致病因素和多基因导致的慢性炎症性的皮肤病,银屑病现在已经是皮肤科门诊相对较为常见的疾病之一。银屑病的主要的临床表现是以表皮角质层细胞的增殖和皮损处的炎症为主要表现。银屑病的特征性的损害为红色的丘疹或斑块上覆盖多层银白色的鳞屑,并且伴有不同程度的瘙痒。该病没有特效的治疗方式,容易复发,根治困难,目前 WHO已经把银屑病列为皮肤病领域的顽症之一。 银屑病的发病因素非常之多,包括外伤、手术、阳光照射、以及药物使用等。目前,本病的发病机制还没有彻底研究清楚。研究者通常认为,在银屑病的发生中免疫系统异常、炎症介质的产生异常起重要的作用。 银屑病的发生、发展是由遗传因素和环境因素共同作用引起来的,而遗传因素发挥着更为主要的作用。国内外的研究者通过使用连锁分析、外显子芯片、GWAS、Meta分析以及靶向测序等大量的研究方法,使得很多银屑病的易感基因及位点被发现。然而现在被发现的位点几乎都是SNP(单核苷酸多态性:single nucleotide polymorphism),插入/缺失变异(InDel)是除SNP以外的银屑病遗传变异中的一种重要的变异类型。 前期我们的团队通过使用靶向测序,发现了6个与银屑病易感性显著相关(P<10E-03)的InDels。这6个InDels分别位于UBLCP1、STAT3、BRD3、PTCHD3、SGSH、NFKBIZ基因上。本次实验应用的是Sequenom平台对前期结果进行验证,并且进一步做了银屑病的基因和表型的关联分析。 目的:本次实验应用的是Sequenom平台对前期结果进行验证,并且进一步做了银屑病的基因型和表型的关联分析。所要分析的银屑病的亚临床表型包括如下内容:发病年龄、皮损类型、发病程度以及有无家族史等。 方法:本次研究选取了中国汉族人群银屑病样本2208例和匹配的健康对照2208例,应用Sequenom平台,对前期发现的6个与银屑病易感性相关的InDels进行验证。用 PLINK1.07对研究结果的数据进行分析检验。之后,合并两次实验阶段的病例12154例和对照12114例的临床信息,做银屑病的基因型与表型的相关性分析。 结果:1对靶向测序的提示基因验证后,基因 UBLCP1(chr5_158639126)、STAT3(chr17_37729176)、BRD3(chr9_135896602)与银屑病的发病有相关性,最显著的是 UBLCP1(chr5_158639126),P=1.69E-4(OR(95%CI)=1.19(1.09-1.30)。然后把靶向测序结果和这次验证的结果进行合并并再次分析,得到 UBLCP1的P=2.75E-14,OR(95%CI)=1.16(1.11-1.20)。实验结果证明该基因与银屑病的发病显著相关。 2分析银屑病表型与UBLCP1基因型的关系,中国汉族人的银屑病的发病时间、发病程度、发病类型、有无家族史与基因UBLCP1(chr5_158639126)(P发病时间=8.90E-01, OR(95%CI)发病时间=0.99(0.90-1.09))的插入缺失变异未发现有显著差异。 结论:中国汉族人群中,基因UBLCP1(chr5_158639126)、STAT3(chr17_37729176)、BRD3(chr9_135896602)与银屑病的发病有显著相关性。银屑病的表型(发病时间、有无家族史、发病类型、发病程度)与基因UBLCP1(chr5_158639126的插入缺失变异没有相关性。