水稻果糖激酶家族基因的表达及功能初步分析

来源 :南昌大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ytvct
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
果糖激酶(Fructokinase,FRK)能磷酸化果糖,是果糖分解代谢途径中很关键的一类酶,广泛存在于细菌和动植物中。研究发现,植物FRK家族基因在其正常生长发育和逆境适应中都具有重要的生物学功能。目前,有关水稻OsFRK家族基因的表达特性和生物学功能研究的报道数量有限。本研究基于生物信息学手段,鉴定出5个水稻OsFRKs,分别命名为OsFRK1~OsFRK5,分析了其结构特点、系统发育树和表达特性等;以粳稻中花11(ZH11)为材料,利用RT-PCR法克隆了OsFRK1~OsFRK3,基于qRT-PCR法分析了OsFRK1~OsFRK3在水稻中的表达特点;采用CRISPR/Cas9等技术获得了OsFRK1~OsFRK4的T!代单基因敲除纯合突变体,并对其部分发育表型性状进行了分析。为进一步研究OsFRK家族基因在水稻生长发育与逆境适应中可能具有的生物学功能奠定了重要基础。主要研究结果如下:1.水稻OsFRKs的主要特征特性基于生物信息学分析发现,5个水稻OsFRKs都具有果糖激酶特有的ATP结合位点和底物识别位点,OsFRK1~OsFRK3可分一个亚家族,OsFRK4~OsFRK5可分为另一个亚家族;5个水稻OsFRKs分布于第1、3、6和8号染色体上,基因大小为2770~6214bp,分别含有2~7个外显子,编码323~589个氨基酸,蛋白分子质量为34.72~65.55 kDa,等电点为5.02~6.60;这5个水稻OsFRKs皆可能在质体中表达,其中OsFRK1还可能在细胞质和线粒体中表达;这些水稻OsFRKs的启动子序列中含有多种与发育、逆境胁迫和激素响应相关的顺式作用元件,暗示它们应该在水稻的生长发育与逆境适应中具有重要作用。2.正常条件下OsFRKs在水稻不同组织部位中的表达模式基于生物信息学分析的组织特异性表达谱结果显示,水稻OsFRKs皆为组成性表达,其中OsFRK4与OsFRK5的表达模式极为相似。然而,基于qRT-PCR法检测结果表明,OsFRK1~OsFRK2和OsFRK4~OsFRK5均为组成性表达,但OsFRK3却为特异性表达(仅在根茎叶中表达);其中,OsFRK1和OsFRK3在第三叶(L3)中表达量最高,而OsFRK2在幼苗根中的表达量更为显著。3.创建了OsFRK1~OsFRK4的T1代单基因敲除纯合突变体利用CRISPR/Cas9技术成功创建了OsFRK1~OsFRK4的To代敲除突变体,其突变率分别为46.4%、92.9%、93.3%和66.7%,经世代分离和分子鉴定后,我们分别获得了 6种(OsFRK1)、6种(OsFRK2)、10种(OsFRK3)和6种(OsFRK4)不同突变类型的Ti代敲除纯合突变体,这4个OsFRKs基因突变后所编码的氨基酸功能结构域序列都遭到破坏或翻译发生过早提前终止现象,只是OsFRK2和OsFRK3的部分突变体存在脱靶现象,后续实验应挑选无脱靶现象的纯合突变体进行,或通过设计新的靶位点,重新创建无脱靶的敲除纯合突变体进行后续实验。4.水稻OsFRK1~OsFRK4敲除纯合突变体的部分发育表型分析本研究对T1代敲除纯合突变体的农艺性状进行考察发现,水稻OsFRK1对水稻的株高、穗长、结实率和千粒重等农艺性状可能没有影响,但OsFRK2和OsFRK3却对水稻主穗的结实率和千粒重有明显的影响,说明OsFRK2和OsFRK3很可能在水稻穗部性状发育中具有重要作用。而OsFRK4的T1代敲除纯合突变体存在明显的白化致死表型,说明OsFRK4对水稻叶绿体的正常发育很可能是必需的。此外,本研究对水稻OsFRK2的T2代敲除纯合突变体的幼苗生长进行观测发现,突变体的根和根上部分的生长势都比野生型差很多,说明OsFRK2很可能在水稻幼苗的生长发育中具有十分重要的作用,但有待进一步实验证实。
其他文献
全球的环境污染和日益严重的温室效应,促使新能源汽车开始进入人们的视野,随着汽车产业的发展,世界各国对电动汽车越来越重视,很多的汽车制造商和研究所开始对电动汽车进行深
供水管网系统是保障城镇正常运作的重要基础设施之一,关系到人民生活、企业生产和社会发展,是紧密联系净水厂和用户的重要载体之一,在饮用水的存储、运输和调度上发挥重要作
近年来,全球能源危机与环境污染问题日益严重,传统燃油汽车越来越不能满足时代发展的需求。可再生能源与传统汽车相结合成为研究热点,以太阳能为一次能源的光伏电动车就是其
目的在传统体质理论基础上,通过对过敏性鼻炎和健康人群进行体质特征比较,挖掘过敏性鼻炎人群的体质特征;评价艾灸疗法对过敏性鼻炎体质特征的影响及临床疗效。方法1、对社区
实验目的:本论文旨在采用正交试验方法优化蒙药地梢瓜的不同溶剂提取工艺,体外评价提取物的抗氧化活性,并对其中的部分药物单体进行分离、纯化与鉴定。实验方法:通过单因素实
高大空间建筑空调系统气流组织方案有多种形式,其中分层空调是能有效节约空调能耗的最合理的气流组织形式。但在实际工程中,分层空调还存在着实际气流组织效果不理想,能耗依
随着基于光伏和风电等可再生能源的分布式发电飞速增长,并网逆变器在电力系统中得到越来越广泛地使用。并网逆变器根据应用环境和控制目标的不同可以分为有功/无功功率控制型
超级电容器因为功率密度高,充放电速率超快并且理论使用寿命远高于二次电池等吸引了越来越多的关注,人们越来越重视超级电容器尤其是可穿戴超级电容器设备的设计开发,在这些
为满足某型号导弹长时间超声速巡航飞行战术技术指标要求,论文采用理论推导、仿真分析和试车台试验三者相结合的方法,围绕流量可调固体冲压火箭发动机的推力调节控制技术开展
测试技术中传感器信号放大技术一直是业内研究的主要方向,对于传感器检测信号核心部件响应单元效率提升的研究是很有必要的。因此本文建立了一种新的非对称变截面悬臂梁机电