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本研究测定了蒲江猪场人工培育藏猪种群108个个体的体尺、体重等生长发育性状,利用DNA直接测序法检测了蒲江猪场人工培育藏猪种群108个个体SLA-DRB基因和八个地区藏猪共计239个个体POU1F1基因的单核苷酸多态性,探讨了这两个基因多态位点的群体遗传结构,分析了蒲江猪场人工培育藏猪种群单核苷酸多态位点及其组合与生长发育性状的关联性。2-9月龄生长发育性状研究结果表明,蒲江猪场人工培育藏猪种群生长发育性状在不同性别间有差异,母猪4～7月龄的胸围、4～9月龄的腹围、5～8月龄的胸宽、6-7月龄的胸深、5-9月龄的腰角宽、6月龄的尻长和头深、5～7月龄的体重显著大于公猪(P<0.05)。对藏猪SLA-DRB基因的SNP及其与生长性状的关联分析结果表明,SLA-DRB基因第三内含子、第四外显子和第四内含子序列中共检测到14个SNP位点,其中位点g.11369C>G, g.11387A>G、g.11470A>G、g.11478C>T、 g.11532A>G、g.11829A>G、g.11838C>T、g.11944C>G、g.11945A>G、 g.11997C>T处于中度多态(0.25<PIC<0.5),位点g.11440C>T、g.11468C>T、 g.11708C>T、g.11911T>G处于低度多态(PIC<0.25)；卡方适合性检验显示,除g.11468位点处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05)外,其余13个SNP位点均处于不平衡状态；单一位点与生长性状间的关联分析表明,SLA-DRB与藏公猪2-4月龄的生长发育密切相关,与藏母猪的生长发育关联性较弱,利用SNP位点基因对此群藏猪生长发育性状进行早期选择时需考虑性别差异。对藏猪POU1F1基因的SNP及其与生长性状的关联分析结果表明,来自八个地方共239个藏猪的POU1F1基因内含子四序列中共检测到g.13952A>G、 g.14009A>G、g.14192T>C、g.14384G>C、g.14387A>G、g.14392C>G。 g.14464T>A共7个SNP位点,其中,得荣县、德格县的藏猪7个SNP位点都检测到了；稻城县的藏猪有5个SNP位点,未检测到g.14009A>G和g.14392C>G；巴塘县、丹巴县的藏猪有6个SNP位点,未检测到g.14392C>G；；甘孜县检测到6个SNP位点,未检测到g.14387A>G；乡城县的藏猪只有g.14387A>G1个SNP位点；蒲江县的藏猪检测到4个SNP位点,未检测到g.14009A>G、g.14387A>G和g.14392C>G。蒲江猪场人工培育藏猪种群的POU1F1基因第4内含子中共检测到g.13952A>G、g.14192T>C、g.14384G>C、g.14464T>A共4个SNP位点,经连锁不平衡分析表明,g.14192和g.14384突变位点表现为完全连锁。单个SNP位点与生长发育性状关联分析结果表明,g.14464位点的TT型雌雄个体、g.13952位点的AA型和AG型雌性个体的生长速度较慢,可将藏猪POU1F1基因g.14464位点T等位基因的劣势效应作为标记辅助选择(MAS)的参考。单体型组合与生长发育性状的关联分析结果表明,单体型H1H1的长势在所测单体型组合中最慢,在藏猪进一步小型化培育过程中应特别注意对单体型H1H1个体的选留。