SH2B1和TBC1D1基因多态性与家兔生长性状以及部分屠宰和肉质性状的关联分析

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gsxs
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
SH2B1和TBC1D1是胰岛素信号通路上具有生物学作用的信号因子,在胰岛素信号通路调节葡萄糖摄取的过程中发挥关键作用。本试验通过直接测序技术检测SH2B1部分mRNA序列和TBC1D1基因编码区序列的SNPs位点,采用HRM技术、RFLP技术和生物质谱技术对5个家兔品种共722个样本的候选SNPs位点进行基因分型;应用最小二乘法对SH2B1和TBC1D1基因SNPs位点与家兔多个生产性状进行关联分析;采用实时荧光定量技术检测35日龄,56日龄,70日龄肝脏组织中SH2B1基因mRNA相对表达量,分析不同发育阶段以及不同基因型mRNA相对表达量的关联性。试验结果如下:(1)SH2B1基因mRNA的3’UTR区检测到2个SNPs位点,分别为r.*464T>C和r.*749 G>A; TBC1D1基因检测到12个SNPs位点,其中7个同义突变SNPs位于TBC1D1的TBC结构域(c.2451G>A, c.2514A>G, c.2535G>A, c.2589G>A, c.2763T>C, c.2844T>C, c.2937G>T),4个同义突变位点(c.153T>C, c.252A>G,c.564G>A, c.591G>A)和一个非同义突变c.214G>A (Gly72Arg)分布在两个PTB结构域上。根据mRNA中3’UTR区和非同义突变的生物学功能,本实验对SH2B1基因的r.*464 T>C位点和TBC1D1基因c.214G>A位点于家兔的生产性状进行分析。(2)SH2B1基因r.*464 T>C位点在新西兰兔(288)、香槟兔(74),伊拉兔(85)和天府黑兔(56)中均检测到CC、TC和TT 3种基因型。新西兰兔3种基因型频率分别为0.177、0.576和0.247,香槟兔3种基因型频率分别为0.24、0.554和0.203,伊拉兔3种基因型频率分别为0.083、0.435和0.482,天府黑兔3种基因型频率分别为0.089、0.661和0.250;在新西兰兔,伊拉兔和天府黑兔中T等位为优势等位基因,频率分别为0.535、0.700和0.58.0,而在香槟兔中C等位基因为优势等位基因,频率为0.520。r.*464 T>C位点在4个品种中表现为中度遗传多态。(3) TBC1D1基因c.214G>A位点在欧洲大白兔(206)、新西兰兔(287)、香槟兔(81),伊拉兔(87)和天府黑兔(61)中均检测到AA、GA和GG 3种基因型。欧洲大白兔3种基因型频率分别为0.639、0.278和0.083,新西兰兔3种基因型频率分别为0.489、0.357和0.154,香槟兔3种基因型频率分别为0.012、0.086和0.902,伊拉兔3种基因型频率分别为0.011、0.138和0.851天府黑兔3种基因型频率分别为0.016、0.197和0.787;在欧洲大白兔和新西兰兔中,A等位基因为优势基因基因,频率分别为0.780和0.670,c.214G>A位点表现为中度遗传多态性;在伊拉兔,香槟兔和天府黑兔中G等位基因为优势等位基因,频率分别为0.919、0.944和0.885,c.214G>A位点表现为低度遗传多态性。(4)SH281基因r.*464 T>C位点各基因型与生产性状关联分析结果表明,新西兰兔中,CT基因型个体56日龄体重、35-56日龄日增重(ADG35-56)显著(P<0.05)高于CC基因型个体;伊拉兔中,CC基因型个体84日龄体重、日增重ADG70-84显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)高于TT基因型、CC基因型个体。在香槟兔中,TT基因型个体的全净膛重、半净膛重显著(P<0.05)高于CC基因型,CC基因型的背最长肌肌间脂肪含量显著(P<0.05)高于TT基因型。表明SH2B1基因r.*464 T>C位点遗传变异及与生长性状的关联性具有品种差异,该位点对屠宰性状和肉质性状的影响不一致,TT基因型在香槟兔中具有较高的屠宰性状,CC基因型具有较高的肉质性状。(5) TBC1D1基因c.214G>A位点各基因型与生产性状关联分析结果表明,新西兰兔中,AA基因型和GA基因型个体的35日龄体重极显著(P<0.01)高于GG基因型,欧洲大白兔中,GA基因型个体的56日龄重和日增重ADG35-56显著(P<0.05)高于GG基因型个体。说明等位基因A分别对两个群体的35日龄重和56日龄重有正效应。(6)SH2B1基因mRNA相对表达量在家兔肝脏组织随着日龄的增长而上升,70日龄时SH2B1基因mRNA相对表达量极显著(P<0.01)高于35日龄,显著(P<0.05)高于56日龄,35日龄和56日龄之间的差异不显著(P>0.05),表明SH2B1基因mRNA表达具有发育阶段性。SH2B1基因r.*464 T>C位点不同基因型与SH2B1基因mRNA相对表达量之间的差异未达到显著水平(P>0.05),表明SH2B1基因r.*464 T>C位点多态性与SH2B1基因mRNA相对表达量相关不显著。本研究表明,SH2B1基因r.*464T>C位点和TBC1D1基因c.214G>A位点可以作为与家兔生长速度、屠宰和肉质性能的遗传标记,但存在品种差异。
其他文献
甘蔗农艺和经济性状的统计分析表明:喷施稀土对甘蔗的增产作用,主要是提高成茎率从而增加甘蔗的有效茎数;喷施稀士对甘蔗的增糖作用,主要是促熟而提高了成熟早期的蔗糖分;喷
小学语文作业的现状令人堪忧,教师设计的作业量多且形式单一,学生只是简单机械地完成作业,严重打击学生学习的积极性,同时对学生思维以及创造力的培养也毫无益处.
网络管理机制为档案信息管理提供一个高效采集和保存的系统,档案信息资源具有数量众多、采集困难、种类庞杂的特性,利用网络管理机制提高档案信息收集个保存,但由于我国网络
1教材分析rn1.1地位和作用rn铁的性质是初三教材第六章第一节内容.在此之前,教材已讲述了氧气、氢气和碳三种非金属单质,再安排一章铁,使学生既学习了一定的非金属单质,又接
学生从初中进入高中之后,面对学习内容、环境以及教师授课方法等方面的改变,经常会导致其心理承受能力、认知能力等方面产生诸多矛盾,特别是在数学学习上.对此,为了能够让高
我局从1954年以来,为了解决矽危尘害,每年都要支付相当大的费用来加强矿井通风防尘工作。根据1957年至1980年间21年(1967~1969三年未计入)的统计,南矿的通风费用累计达787.8
随着时代的发展,档案管理工作中,通过与数据技术的有机结合,不仅提升了工作效率,对推动社会的进步也能够起到积极作用.现阶段而言,数字档案的建设过程中,参与式建设越来越被
习作分层教学大大提高了学生的写作兴趣,同时也成就了学生独具风格的表达.关注个性差异,实施分层教学、分类指导,可以在习作教学中彰显学生个性,所有学生都能够得到最适合其
研究工作考察了最近发展的高梯度磁选法(HGMS)。在作用力平衡的基础上介绍了高梯度磁选法的原理。在铁矿石选别时,甚至在低磁场强度下,能指望得到满意的分选结果。本方法在
文章调查分析了高中生对音乐的态度,从教师与学生这两把利剑入手,结合教学实践思索了一些建议性的提升方法.