目的:对比分析原发性肝癌患者及肝癌TACE治疗前后肠道菌群的多样性变化及菌群结构差异。初步探讨肠道菌群与肝癌的关系,为肝癌的微生态治疗靶点提供理论依据。方法:本文通过采集原发性肝癌患者及健康人的粪便标本,以肝癌患者与健康人分组相互对照,肝癌TACE治疗前及TACE治疗后对照。对所有标本分离提取出总DNA,采用Illumina技术对标本16S rDNA V4可变区行高通量（HiSeq PE250）测序。以97%的一致性将序列聚类成为OTUs,对OTUs的代表序列进行物种注释。接着对分组样本菌群进行物种相对丰度比较、物种多样性比较、菌群结构差异对比、差异显著物种分析等,并结合临床资料对疾病特征进行菌群相关性分析及差异性比较。研究肝癌患者与健康人、肝癌TACE治疗前后肠道菌群多样性变化及菌群结构组成特点。结果:1、肝癌组及TACE治疗组与健康组肠道菌群组成在不同物种分类水平其相对丰度不同。在门水平,拟杆菌门相对丰度在肝癌组低于健康组,厚壁菌门相对丰度在肝癌组及TACE治疗组均低于健康组;而变形菌门及梭杆菌门相对丰度在肝癌组及TACE治疗组均高于健康组。在科水平,普氏菌科、毛螺菌科、瘤胃菌科相对丰度在肝癌组及TACE治疗组均比健康组低,而拟杆菌科、肠杆菌科、梭杆菌科等相对丰度均比正常组高。在属水平,普氏菌₉属、巨单胞菌属相对丰度在肝癌组及TACE治疗组低于健康组,而拟杆菌属、韦荣球菌属、大肠埃希氏菌属、梭杆菌属、梭菌属相对丰度高于健康组。2、组间物种Alpha多样性比较。多样性指数Observed species（264±47VS 230±64）及 ACE（282.56±50.88VS 253.20±75.01）健康组均大于肝癌组,健康组物种丰富度高于肝癌组,差异具有统计学意义（P<0.05）;Shannon 指数,健康组大于肝癌组（4.56±0.70VS 4.37±0.77）,Simpson 指数健康组小于肝癌组（0.87±0.09 VS 0.89±0.08）,健康组物种多样性高于肝癌组。肝癌TACE治疗前与治疗后Alpha多样性指数相近,两组肠道菌群物种丰富度及均匀度相似,TACE治疗后菌群结构未发生明显改变。3、组内结构及组间结构分析。NMDS分析显示,健康组样本点与点距离较近,能较好的聚集在一起,组内结构相近;肝癌组样本点的分布较为分散,组内结构差异较大;健康组与肝癌组各样本点大致分开分布于特定区域,组间结构存在差异。肝癌TACE治疗前（肝癌组）与治疗后各组内样品点与点距离较远,组内结构差异均较大;两组样品点的分布范围大致一致,肝癌TACE治疗前后肠内菌群组间结构相似。Anosim分析显示,肝癌组与健康组组间的秩均较组内的秩高,R>0,健康组及肝癌组组间结构差异大于组内差异差异,且差异具有统计学意义（P<0.05）;TACE治疗前后组间的秩低于TACE治疗前,R<0,TACE治疗前后组内结构差异大予组间结构差异。4、健康组与肝癌组组间物种差异显著性分析。健康组中差异显著物种有:厚壁菌门、梭菌目、梭菌纲、瘤胃菌科、Subdoligranulum、Plebeius拟杆菌。肝癌组中差异显著物种有:变形菌门、γ-变形菌纲、肠杆菌目、肠杆菌科、埃希氏杆菌属、大肠埃希菌;梭杆菌门、梭杆菌纲、梭杆菌目、梭杆菌科、梭杆菌属;同属于厚壁菌门的芽孢杆菌纲、乳杆菌目、链球菌科、链球菌属、韦荣球菌属;拟杆菌门的脆弱拟杆菌。5、肠道差异菌丰度变化与临床特征分析。肝癌患者肠内机会致病菌（拟杆菌属+韦荣球菌属+埃希氏菌属+梭杆菌属+梭菌属）及潜在益生菌（普氏菌科+毛螺菌科+瘤胃菌科）与CTP评分、总胆红素、白蛋白、谷丙转氨酶、谷草转氨酶存在相关性。肝癌患者肠内机会致病菌相对丰度随着肝功能Child-Pugh分级的递增而增加,且机会致病菌在Child-Pugh C级中的相对丰度分别与Child-Pugh B级、Child-Pugh A级相比,组间差异具有统计学意义（P<0.05）。潜在益生菌相对丰度随着肝功能Child-Pugh分级的递增呈现减少趋势,其相对丰度在Child-Pugh C级与Child-Pugh A级组间的差异具有统计学意义（P<0.05）。结论:1、原发性肝癌患者与健康者肠道菌群组成在不同物种分类水平上的相对丰度不同,肝癌患者肠道菌群结构失调,表现为益生作用菌减少,而大肠杆菌属、梭杆菌属等机会性致病菌增加;2、原发性肝癌患者肠道菌群丰富度及多样性均低于健康人,菌群结构存在明显差异;3、原发性肝癌患者TACE治疗前后肠道菌群丰富度及多样性相近,菌群结构相似,TACE治疗对肠道菌群影响较小;4、产SCFAs的肠道潜在益生菌对于原发性肝癌患者益生菌制剂的研发提供参考方向;5、肠道菌群失调与肝癌存在关联,随着肝功能Child-Pugh等级的递增,菌群失调程度更为明显,对于肝功能损害程度越高的患者有必要行肠内菌群调整的干预治疗。