鹅HMGR基因内含子5克隆、SNP及其与鹅重要经济性状关联分析

来源 :安徽农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:xlinda
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3—羟基—3—甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR)是胆固醇代谢过程中的限速酶,是在有约25个酶参与的胆固醇合成中最重要的一个酶。本文提取皖西白鹅血液基因组DNA,参照人,鸡,猪HMGR基因的外显子,利用DNAStar软件确定该基因在外显子5和6上的保守区,设计引物克隆并测序了HMGR基因第五内含子,并用PCR-SSCP技术检测了HMGR基因第五内含子,并分析了SNPs与鹅重要经济性状的关联性。结果表明:1.通过克隆与测序表明HMGR基因内含子5的是由704bp组成的,该项结果在GenBank上登录,收录号EF595972。2.经PCR-SSCP分析,发现该内含子5存在1个SNP位点,由一对等位基因A和B构成,形成了AA和AB两种基因型。3.检测116只皖西白鹅,发现AA型个体为63,AB型个体为53,AA和AB型的基因型频率分别0.5431和0.4569,等位基因A和B的基因频率分别为0.7716和0.2284。经卡方检验,该皖西白鹅群体不处于Hardy-Weinberg平衡状态。4.分析不同基因型与鹅重要经济性状之间的关联性,结果表明:AA型可以显著提高鹅的胸肌重和腺胃重(P<0.05),显著增加胸肌纤维直径(P<0.01),降低胸肌45pH(P<0.05),明显增加千朵重,降低绒系水率,提高羽绒的防水性。AB型则对降低胸肌重、腺胃重、胸肌率和千朵重的遗传效应显著(P<0.05),并具有显著降低胸肌纤维直径(P<0.01)和提高胸肌45pH的作用(P<0.05)。可见AA型有利于提高羽绒的防水性和胸肌、腺胃的发育,AB型有利于鹅肉质品质的提高。
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