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鸡传染性支气管炎(Infectious bronchitis, IB)是由冠状病毒科(Coronaviridae)传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus, IBV)引起的一种急性高度接触性传染病。该病主要侵害鸡的呼吸系统、消化系统和泌尿生殖系统,可以引起雏鸡死亡,蛋鸡产蛋量及蛋品质下降,给养禽业造成巨大的经济损失。IBV突出的特点是血清型众多,且新的血清型和变异株不断出现,给本病的防治带来很大困难,免疫失败现象时有发生,所以从现地分离株中筛选疫苗株对控制IB非常重要。IBV的基因组为不分节段的单股正链RNA,编码三种主要结构蛋白(纤突蛋白S,膜蛋白M和核衣壳蛋白N)及其它蛋白。IBV的S蛋白可以裂解成S1和S2两个亚单位。S1是重要的免疫原蛋白,能诱导产生中和抗体和血凝抑制抗体,并且与病毒的组织嗜性有关。S1基因的点突变、插入、缺失或者重组是IBV产生新血清型,亚型和变异株的主要原因,对于S1基因的变异与病毒的抗原性的改变之间是否存在一致性尚不清楚。故对S1基因深入研究具有重要意义。从分子水平研究S1基因的分子结构和遗传进化特点,可以为IB的防控提供可靠的理论依据。2008年1月,河北沧州某产蛋鸡场鸡群出现以呼吸道症状为主的疾病症候,并迅速波及全群,少数几只出现死亡,死亡率约0.5%。剖检发现鸡只肾脏肿大,有尿酸盐沉积,呈“花斑肾”样,其它脏器器官未见明显病变。已知该鸡群曾按正常程序进行接种过IBV H120疫苗。本试验收集患病鸡只肾脏、气管等组织,进行病毒分离培养。通过新城疫病毒干扰试验、致鸡胚矮小化试验、血凝特性试验、动物回归试验以及分子生物学试验等证实分离到的0801株为一株传染性支气管炎病毒。交叉中和实验结果显示,0801株与Ma5、W93、H120、M41、H52株的关系系数R分别为80.7%、67.7%、73.3%、54.0%、70.8%。依据判定标准(R>80%,两毒株为同一亚型;25%<R<80%,两毒株为同一血清型的不同亚型;R<25%,两毒株为不同的血清型),判定0801株与疫苗株Ma5、W93、H120、M41、H52株均为同一血清型,其中与疫苗株Ma5株为同一血清型的同一亚型。本研究中对0801株S1基因进行了序列测定,并与国内外已发表参考株S1基因进行了比较分析,结果表明,0801株与当前普遍应用的Massachusetts型疫苗株H120、H52、Ma5、M41及国内疫苗株W93株核苷酸同源性约为75%,推导氨基酸序列对比结果显示同源性亦约为75%,同时与Genbank注册的Arkansas、Conn、Gray、793/B等血清型同源性差异亦在20%以上。而Genbank BLAST对比结果显示0801株S1基因与国内分离株LC2、WF株S1基因同源性最高,其核苷酸同源性高达99%,氨基酸同源性亦接近99%。序列分析结果显示0801株S蛋白裂解位点序列为RRFRR,符合传支毒株裂解位点序列。