【摘 要】
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合成测序是新一代测序技术之一,具有高通量并行的特点,并且可用于同一区域含有多个相同碱基的核苷酸序列的测定。在合成测序中,需要合成用于测序的可逆终端。这些可逆终端需
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合成测序是新一代测序技术之一,具有高通量并行的特点,并且可用于同一区域含有多个相同碱基的核苷酸序列的测定。在合成测序中,需要合成用于测序的可逆终端。这些可逆终端需要把荧光素通过一个可裂解的连接单元连接到核苷酸,而在可逆终端并入DNA链并被识别检测后,为了不影响下一个核苷酸的并入和检测,需要把荧光素从DNA链上移除。同时,可裂解连接单元需要在温和的条件下实现高效率的裂解。本文基于缩醛保护羟基及脱保护的思想,设计合成了一种具有缩醛结构的可裂解连接单元,使用1HNMR、13C NMR、ESI-HRMS、IR对其结构进行了表征。合成该化合物的原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,易于实现大量合成。在合成过程中得到了该连接单元的一对非对映异构体,本文对其构型进行了分析讨论。为了考察连接单元的裂解性能,本论文还合成了含荧光素的该类可裂解连接单元,并进行了定量的动力学裂解实验。裂解实验结果表明,该化合物在较温和的条件下可以实现高效率的裂解,能用于合成测序中。此外,本论文还合成了通过该连接单元连接的荧光标记核苷酸,可作为合成测序的可逆终端,为下一步测序的应用提供了物质基础。
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