影响毛兔毛纤维生长发育相关基因的筛选及表达趋势研究

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兔毛质地蓬松轻盈,保暖性好,是一种优质的纺织材料,有着重要的经济价值。目前,有很多学者在研究影响动物毛质性状的候选基因,但是主要研究集中于人和羊,而在家兔中的研究很少,这大大制约了毛兔育种的进展。新西兰白兔为肉用型家兔,其被毛为标准毛型,被毛密度较稀,毛纤维直径较粗且粗毛含量高;皖系长毛兔为毛用型家兔,其被毛为长毛型,被毛密度高,毛纤维直径较细。因此本研究以被毛长度和被毛密度差异较大的新西兰白兔和皖系长毛兔为试验材料,采用基因芯片技术和实时荧光定量PCR方法研究与家兔毛纤维生长发育相关基因。本研究主要内容包括:1.利用家兔全基因组表达谱芯片筛选与毛纤维生长发育相关的基因,并且采用实时荧光定量PCR方法对芯片结果进行初步验证。2.采用实时荧光定量PCR技术研究差异表达基因(Wnt10b、SFRP2、 Shh基因)在皖系长毛兔0、2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22周龄公母兔不同部位的表达规律。3.采用实时荧光定量PCR技术研究差异表达基因(Wnt10b、SFRP2、 Shh基因)在新西兰白兔0、2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22周龄公母兔不同部位的表达规律。4.利用PCR-SSCP技术,对皖系长毛兔群体共240个个体的Wnt10b基因外显子3多态性进行研究,并将其与皖系长毛兔体重和毛重进行关联性分析。本研究的主要结果如下:1.利用Aglient家兔全基因芯片表达谱芯片共筛选出1067个在皖系长毛兔和新西兰白兔中差异表达的基因,其中包括714个已知功能基因,284个上调基因,430个下调基因。其中Wnt10b、Shh、Notch1、SH3GL2、SFPR2、DKK4基因可能参与家兔毛纤维的生长发育。2. Wnt10b、Shh、SFRP2基因在皖系长毛兔和新西兰白兔中不同周龄、不同部位、不同性别中的表达趋势虽然不完全一致,但是在0-4周龄,Wnt10b、Shh基因均表现为上调作用,SFRP2基因表现为下调作用。3. Wnt10b基因在皖系长毛兔和新西兰白兔中的变化规律基本一致,0周龄时Wnt10b基因在皖系长毛兔中的表达量低于新西兰白兔,16周龄时,在皖系长毛兔中的表达量低于新西兰兔稍低,但是差异不显著,其它周龄中,均显示Wnt10b基因在皖系长毛兔中的表达量高于新西兰白兔。4. SFRP2基因的表达量在不同品种的同一周龄中存在一定的差异,0、4、6、10、12周龄时,SFRP2基因在皖系长毛兔中的表达量低于新西兰白白兔;2、8、14-22周龄时,SFRP2基因在皖系长毛兔的表达量高于新西兰白兔。5.Shh基因在两个兔品种中的表达变化趋势基本一致。除16周龄时,Shh基因在新西兰白兔中的表达量显著高于皖系长毛兔(P<0.01),其余周龄中,Shh基因在皖系长毛兔中的表达量均高于新西兰白兔。6.皖系长毛兔群体中AA型个体数为179个,基因型频率为0.746,AB型个体数为52个,基因型频率为0.217,BB型个体数为9个,基因型频率为0.038。等位基因A的频率为0.854,等位基因B的频率为0.146,说明在皖系长毛兔中Wnt10b基因外显子3主要以AA基因型和AB基因型为主,表现为低度多态性(PIC=0.218<0.25)。BB基因型的产毛量最高,其中AA基因型的毛重与AB、BB基因型差异显著(P<0.05),AB基因型与BB基因型差异不显著(P>0.05)。BB基因型的体重最重,但是三种基因型之间差异均不显著(P>0.05)。
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