我国加入WTO以来,医药制造业作为高技术产业之一发展迅猛,随着医疗改革的深化,人民对健康需求的增强,以及《“十三五”国家战略性新兴产业发展规划》的出台,医药制造业的市场地位将更重要,同时也面临着新的挑战和机遇。医药制造业是资本密集型和技术密集型产业,关系到国计民生的战略性高技术产业,经过多年的发展,我国医药制造业进步明显,但国际竞争力并没有随着行业规模的扩大而大幅提高,与国外医药制造业巨头还有很大的差距。如何加强技术创新的能力进而提高技术创新效率,使我国从一个医药制造的大国转变成为依靠技术创新、科技进步的创新强国,已经成为当前急需研究的重要课题。本文从选题研究的背景、目的和意义出发,阐明了文章研究的主要内容和整体行文思路,重点展示本文的创新点和主要发现,在研究国内外相关文献的基础上,构建了理论基础,对我国医药制造业发展现状和技术创新现状进行分析。以通过现状分析为基础,构建能够测度和评价我国医药制造业技术创新效率指标体系,基于价值链视角,运用两阶段SFA模型将我国医药制造业技术创新过程划分为技术研发阶段和成果转化阶段,对我国28个省市2004-2015年医药制造业技术创新效率进行测算,得出我国医药制造业技术开发和成果转化阶段技术创新效率变化的结果,分析各省市医药制造业技术创新效率变化的原因。在前人研究基础上,本文结合我国医药制造业自身特点、行业技术创新效率的现状,运用面板数据进行回归分析,从企业自身、市场环境和政府支持三方面分析我国医药制造业技术创新效率的主要影响因素。研究结果表明:R&D技术投入、企业成长和市场结构在技术开发阶段和成果转化阶段都对技术创新效率有显著的正向影响,所有制结构、企业规模和外资影响在技术开发和成果转化阶段对技术创新效率呈现负相关关系,而R&D人员投入对于技术开发阶段有负向影响对成果转化阶段有正向影响,政府支持力度则相反,有利于技术开发阶段的效率提升而对成果转化阶段的效率提升反而起了阻碍的作用。依据研究结论,本文认为应该从建立R&D稳定投入机制、提升规模效率、加快产业结构升级和加强人才队伍建设等方面采取措施促进我国医药制造业技术创新活动的发展。