CLE(CLAVATA3/Embryo surrounding region-related)基因家族编码一类小的分泌肽,广泛参与植物细胞间的信号转导、细胞增殖分化、自我调节以及响应外界刺激。目前,已在拟南芥、水稻、大豆、番茄和杨树等植物中鉴定了大量的CLE基因家族成员,而在油菜中还没有进行过系统地分析。在本研究中,我们对甘蓝型油菜的CLE基因家族成员进行了系统地鉴定和生物信息学分析,利用体外多肽处理的方法对一些油菜特异的CLE基因功能进行验证,并对BnCLE基因的组织表达特异性进行了分析。主要结果如下:1.在甘蓝型油菜全基因组中共鉴定出116个CLE基因家族成员,其中包括5个含有多个CLE基序、7个未注释的新基因。并对它们进行了信号肽、等电点、分子量大小和基因结构等特征的分析。2.染色体定位分析发现,A和C亚基因组各包含53和61个BnCLE基因。整体上,BnCLE基因总是成对的出现在两个亚基因组的同源区域。BnCLE基因家族的扩张方式以大片段复制为主(68%,79/116),其次为全基因组随机转录事件(27%,31/116),串联重复的形式很少(5%,6/116)。3.通过多序列比对和进化树构建,并参照拟南芥中AtCLE基因的功能将BnCLE基因分为三大类:A类主要作用于侧根的生长发育,B类主要维持根和茎顶端分生组织的干细胞动态平衡,C类主要对维管束的发育发挥作用。4.对5个含有多个CLE基序基因进行分析,发现它们各含有2-5个CLE基序,都主要在子房和角果中的表达量较高,暗示它们可能参与了种子的生长发育。5.共发现45个BnCLE基因具有29种新的CLE基序。通过体外多肽处理实验对其中的27种CLE多肽进行了功能验证,发现大部分多肽中的氨基酸变异并未导致其功能的显著分化,而少数CLE基序的变化会导致其功能的改变。6.对48个基因进行了组织表达特异性分析,发现大部分BnCLE基因存在一定的组织表达特异性,同时一些BnCLE基因的不同拷贝间出现表达分化。以上研究结果为油菜中深入开展CLE基因功能、鉴定油菜特异的CLE基因奠定了理论基础。