牛MBD1基因表达的表观遗传调节及其对发育相关基因的作用

被引量 : 1次 | 上传用户:adai1989
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
DNA甲基化是高等真核生物的一种重要的表观遗传修饰方式,通过改变染色质的空间构象,富集特异的转录调控因子影响基因转录。其中甲基化CpG结合蛋白(methyl-CpG-binding domain protein, MBD)家族成员在DNA甲基化介导的基因表达调控中起关键作用,MBD1能通过与低密度甲基化CpG结合调控基因的表达。本研究首先根据牛MBD1基因的mRNA序列设计引物,通过RT-PCR方法检测牛五种成体组织中该基因的表达情况,并针对该基因调节区的12个CpG位点,利用亚硫酸氢盐测序PCR方法(bisulfite-sequencing PCR)分析不同成体组织中CpG位点的甲基化状态。其次,收集体外成熟不同培养阶段卵母细胞(GV期、8h、12h、18h、24h)及体外受精不同发育时期胚胎(2-cel、4-cel、8-cell、囊胚),检测各阶段MBD1基因的表达情况及该基因调控区CpG位点的DNA甲基化状态。最后,利用染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation assay, ChIP)技术检测卵母细胞不同成熟阶段(GV期、MⅡ期)及体外受精8-16细胞期胚胎中MBD1蛋白对多能性相关调控因子Nanog、Oct4和母源性相关分子Hlfoo及ZAR1等基因的调节作用。研究结果表明,牛五种不同组织中MBD1基因转录水平不同,其中在心脏、肾脏、肝脏、卵巢、睾丸的表达水平依次升高。不同组织中MBD1基因调节区12个CpG位点的DNA甲基化状态也呈现不同,心脏、肾脏、肝脏、卵巢、睾丸中DNA甲基化比率分别为49.17%、30%、87.50%、81.67%、79.17%。转录水平相对较低的心脏和肾脏中MBD1基因调节区的DNA甲基化比率低于转录水平相对较高的肝脏、卵巢和睾丸。不同成熟阶段的卵母细胞和不同发育阶段胚胎的研究结果表明,MBD1基因表达水平在不同成熟阶段的卵母细胞均有表达且有显著性差异,MBD1基因调节区的CpG位点的甲基化状态及比率也没有变化(均为83.3%),特别是ATG上游-443bp及-696bp位的CpG位点始终保持非甲基化状态,其他CpG位点则始终保持甲基化状态;在植入前胚胎发育阶段,只在2-cell期检测到了MBD1基因的表达,从4-cell期直到囊胚期均检测不到MBD1基因的表达,MBD1基因调节区的CpG位点的甲基化状态及比率与卵母细胞时期完全一致。ChIP结果显示,在GV期、MⅡ期卵母细胞及体外受精胚胎的8-16细胞期,MBD1蛋白始终与Hlfoo基因的调控区相结合;MBD1蛋白在GV期和MⅡ期卵母细胞中与Nanog基因调控区相结合,在8-cell期解离;MBD1蛋白在GV期卵母细胞中与Oct4基因调控区结合,在MⅡ期卵母细胞和8-cell期处于解离状态;MBD1蛋白在GV期卵母细胞中与ZARl基因调控区无结合,在MⅡ期卵母细胞中处于结合状态,而在8-cell期处于解离状态。综上所述,牛不同组织间的MBD1基因表达水平不同,其调节区的DNA甲基化水平和甲基化模式也不同,表明DNA甲基化可能在调节MBD1基因的组织特异性表达中起作用。MBD1基因从卵母细胞不同成熟阶段到2-cell胚胎期维持相对稳定的转录水平,2-cell胚胎期之后检测不到MBD1基因的表达,但MBD1基因调节区的CpG位点的甲基化状态未发生改变,与之前卵母细胞及2-cell胚胎期相同,说明MBD1在卵母细胞成熟过程中积累并作用于早期胚胎发育,也表明着MBD1基因的表达受DNA甲基化、其他的表观遗传方式和转录后修饰等共同调节。通过ChIP分析MBD1在不同时期的卵母细胞和早期胚胎与Hlfoo、Nanog、Oct4、ZAR1等基因的结合状态表明,在胚胎发育的过程中,MBD1会选择性地与特定的基因在特定的时间发生动态结合/解离,从而调节相关基因的抑制/活化,即MBD1的调控作用具有选择性及时空性。
其他文献
本文在对国外有关流体机械专著和教材综合分析的基础上,系统分析了国外流体机械在新技术进展、工程规范、工程应用以及相关教材编写形式、内容安排和习题选取等方面的特点。
产业支撑不仅是城镇化持续发展的内生动力,还是解决就业问题的关键所在,更是维护社会稳定的重要保障。"四化同步"和"产城融合"的相继提出,进一步揭示产业对新型城镇化发展的
生物基芳香平台化合物2,5-呋喃二甲酸(2,5-FDCA)有望替代现有的石油基单体对苯二甲酸用于高性能高分子材料的合成。如何通过高效、廉价的路线制备2,5-FDCA已经成为近几十年的研
目的探讨中西方结直肠癌治疗及预后的差别。方法对本中心的1 321例结直肠癌患者临床病例资料及随访数据进行分析,并与Surveillance,Epidemiology and End Resluts(SEER)数据
为实现中国粮食增产500亿kg,玉米作为中国粮食增产的主力军,选育并应用优良玉米新品种是提高玉米单产保证总产持续增加的主要途径。通过利用玉米优异资源为基础,集成"高大严"
现代市场经济的核心是信用经济。随着我国市场经济尤其是金融市场的发展,商业银行征信体系已经成为促进我国经济金融发展的重要因素,建设商业银行征信体系是降低商业银行不良
多媒体教学手段已经在高校思政课教学中得到普遍应用并起到了激发学习热情等多方面的作用,为充分发挥多媒体教学手段的积极作用并不断提高思政课教学的实效性,思政课教师必须
成本管理作为现代企业管理的一个重要组成部分,自20世纪70年代以后越来越多的受到了重视。它是通过对构成产品成本各种因素及影响产品成本的各个经营环节实施管理,以达到降低
与世界上其他国家一样,伴随着我国经济的迅速发展,人民法院受理民事案件的数量在近十年以每年超过百分之十的速度大幅度增长,由于司法资源的稀缺性和立法与司法践行公平与效