一直以来,农民的医疗保障问题制约着农村经济的发展。新型农村合作医疗（以下简称“新农合”）制度是国家推进农民健康保障体系的一项重大制度安排，而新农合定点医疗机构在新农合体系中扮演着十分重要的角色，是整个新农合运作机制中的重要枢纽,它既是医疗卫生行为的实施者，医疗费用支付的接受者，又手握医疗基金支付的“话语权”，其行为能力、行为质量关乎着合作医疗的开展。随着新型农村合作医疗的深入开展，新农合的监管问题日益突出，定点医院的不规范行为问题日益突出，既加重了老百姓的负担，又加剧了新农合基金运行风险，从而影响了新农合的有序健康运行。　　鉴于目前新农合运行面临的新形势和新要求,本文采用查阅文献、实地调查和典型个案分析相结合的研究方法,以江西渝水区为样本，从目前新农合管理现状出发,在对调研数据和访谈结果进行客观、科学分析的基础上，运用相关理论分析了目前新农合、监管存在的问题以及核心利益相关者可能存在和发生的风险，强调新农合监管的必要性，从引入竞争、加强立法、科学行政、信息化管理等方面提出解决问题的可能路径和方法，为进一步完善新农合定点医疗机构管理机制提供政策参考。