结核分枝杆菌rpoB、katG和inhA基因突变株体外最小抑菌浓度的研究

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目的:探讨结核分枝杆菌耐利福平、异烟肼临床分离株rpoB、katG和inhA基因不同突变位点对体外最小抑菌浓度(MIC)的影响,以期为临床用药提供参考;将实验菌株进行利福平与异烟肼相关耐药基因芯片检测,并与常规药敏进行比较分析评价芯片检测技术的临床应用价值。方法:利用芯片检测技术收集长沙市中心医院2014年1月1日~2015年12月30日结核分枝杆菌rpoB、kat G和inhA基因突变菌株和野生型菌株,采用罗氏培养法进行菌种复苏,并进行不同浓度利福平和异烟肼药敏试验,观察不同基因突变类型的菌株引起利福平和异烟肼MIC值的变化并比较分析基因芯片法与传统药敏法的一致性。结果:实验中利福平rpoB基因突变株71株,野生型58株,异烟肼katG和inhA基因突变株66株,野生型32株。1.利福平rpoB基因突变株MIC值测定中,野生型58株MIC值为8.84±10.3μg/ml,rop B基因突变菌株中531(C→T)为20株,MIC值为576.0±131.3μg/ml,526(C→G/T)为18株,MIC值为355.5±252.6μg/ml,516(A→G/T)为17株,MIC值为432.9±157.6μg/ml;野生型的MIC显著低于三个突变组(p=0.00<0.05),差异有统计学意义,其他单位点、双位点及三位点突变株MIC值均较高;突变菌株中531(C→T)MIC值与526(C→G/T)、516(A→G/T)比较差异显著(分别为p=0.016<0.05和p=0.033<0.05),而526(C→G/T)和516(A→G/T)之间差异没有统计学意义(p=0.849>0.05)。2.69株利福平比例法耐药株中有68例芯片法rpoB基因突变,灵敏度为98.6%,60株利福平比例法敏感株中有57例芯片法为野生型,特异性95.0%;基因芯片检测耐RFP基因时(χ~2=0.062,P=0.803>0.05),基因芯片法和传统药敏比例法比较没有显著性差异。3.异烟肼katG和inhA基因突变株MIC值测定中,32株野生型的MIC值为0.06±0.05μg/ml,20株inhA-15(C→T)突变菌株MIC值为0.37±0.09μg/ml,46株KatG315(G→C/A)突变株MIC值为5.76±4.06μg/ml;野生型的MIC显著低于两个突变组(均p<0.05),差异有统计学意义,突变株中inhA-15(C→T)与315(G→C/A)比较差异显著(p=0.00<0.05)。4.68株异烟肼比例法耐药株中65例基因芯片法基因突变,灵敏度95.6%,30例比例法异烟肼敏感株中29例芯片法为野生型,特异性96.7%;基因芯片法检测耐INH基因时,(χ~2=0.094,P=0.759>0.05),基因芯片法和传统药敏比例法比较没有显著性差异。结论:1.耐药基因突变位点存在地区差异性,长沙市中心医院分离耐RFP菌株以rpo B基因531位点突变为主,耐INH菌株以KatG315和inhA-15位点突变为主。2.RFP和INH相关耐药基因rpoB、katG和inhA存在多种突变模式,不同的突变模式在耐药表型上存在差异。3.基因芯片法有高度的灵敏度和特异性,芯片法可以代替传统药敏法快速筛查结核分枝杆菌的耐药性。
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