21世纪科技发展日新月异，科技投入日益受到各国的重视。地质勘查科技投入是地质勘查工作可持续发展的必要保障，对地质勘查科技投入效果进行科学有效的评价是实现地质勘查科技投入科学合理化和效率化的重要手段。本研究在文献回顾的基础上对地质勘查科技投入机制进行分析，构建指标体系，运用数据包络分析方法对我国地质勘查科技投入效果进行评价，提出切实可行的地质勘查科技投入新机制，为地质勘查工作可持续发展提供有力支撑。本文主要的研究成果如下：1、构建了科技投入理论框架。基于技术创新理论以及内生增长理论，本研究构建了科技投入的理论框架，说明了科技投入的重要性，为科技投入效果评价指标体系的设计以及科技投入新机制的提出提供了系统的理论支撑。2、设计了科技投入效果评价指标体系。在文献阅读的基础上，遵循指标体系的构建原则，结合地质勘查行业特征，从投入和产出两个角度设计了包含科技经费、科技人员、课题数和发表论文数等指标的科技投入效果评价体系。3、评价了地质勘查科研机构科技投入效果。运用数据包络方法中的BC2模型，对19个地质勘查科研机构2009年的科技投入效果进行评价，并对总体效率、技术效率、规模效率以及改进值进行分析，丰富了相关实证研究的内容。研究发现，一些科研机构投入产出效果良好，但也有一些机构仍存在着人员浪费、经费利用不充分等现象，大部分科研机构的课题数量以及论文数量都还需要有所提升。4、提出了地质勘查科技投入新机制。结合我国地质勘查科技投入现存的问题以及科技投入效果评价得出的结果，借鉴发达国家科技投入有益的经验，本研究提出促进地质勘查科技投入良性循环的新机制，从战略导向、资金保障、科技立法、科技人才培养、科技成果转化与应用以及科技国际交流合作等六个角度为“十二五”期间地质勘查科技投入提出科学合理的、具有可行性的政策建议。