2008年我国人均GDP达到3400美元，2011年我国人均GDP达到5400美元，按照国际比较研究以及相关经济理论，我国总体上已进入工业化中后期阶段。每一个工业化阶段都对应着一定的经济增长的驱动要素，结合我国实体经济的运行状况来看，我国现阶段经济增长要逐渐实现主要由要素、资本驱动向主要由资本、技术驱动转变。因此，创新已经上升成为我国国家层面的经济发展战略，也是我国现阶段实现经济发展方式转变的主要途径。　　 本文首先梳理了创新的相关理论，综合部门创新理论、技术轨道理论、产业协同理论、国家创新系统理论来探索我国总体产业层面的自主创新机制。在分析了我国自主创新的概况后，从工业经济模块、人力资源模块、环境模块、技术产出模块、创新产出模块五个方面构建了我国创新系统的系统动力学模型，并且模型在创新系统理论的基础上，纳入了产业层面的创新因素，从而形成了我国总体产业层面的系统动力学模型。最后，本文根据我国总体产业层面的系统动力学模型的运行机制，提出了促进我国自主创新的对策建议。