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目的:佛手是芸香科植物佛手Citrus medica L.var.sarcodactylis Swingle.的干燥果实,又称为“佛手柑”“五指橘”“蜜罗柑”等,在我国具有悠久的种植和药食两用历史,主要分布于四川、广东、浙江、福建等地。2020版《中国药典》中仅以单一成分橙皮苷作为佛手的质控指标,不仅缺乏特异性也无法全面评价佛手质量,活性研究也多集中在大类成分的作用,于具体有效成分少有涉及,药效物质基础不明确,对其成分与功效之间的关系研究也不清楚,无法确定佛手真正与功效密切相关的成分作为质控指标,影响佛手的质量评价及临床疗效,阻碍了佛手的进一步的开发,因而需深入探讨佛手的药效物质基础及其作用机理,为药材的质量控制和临床用药安全提供准确、科学的依据。本论文旨在引入了“质量标志物”这一新概念,建立了佛手Q-markers的研究方法,确定其功效Q-markers并且建立相关Q-markers的HPLC含量测定方法,为佛手进一步的质量控制提供科学依据。方法:（1）采用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱（UPLC-Q-Orbitrap HRMS）对佛手进行全面成分鉴定。根据化合物的色谱保留、准确分子量、特征碎片离子等信息进行质谱解析,明确化学归属。（2）应用中药血清药物化学研究方法,采用UPLC-Q-Orbitrap HRMS对佛手进行血中移行成分研究,结合佛手全成分分析鉴定结果筛选佛手的入血原型成分,明确佛手的药效物质基础,为佛手的活性成分研究和优选质量指标奠定了理论基础。（3）引入网络药理学研究方法,以佛手入血原型成分作为网络药理学的研究对象,采用靶点预测及基因本体（GO）功能注释等技术发掘其对临床主要应用疾病（慢性胃炎、功能性消化不良、消化性溃疡、抑郁症）发挥疗效的关键靶点,解析其主要作用通路与生物学过程,进而探讨佛手“成分-靶点-通路”的网络关系,探讨其对临床主要治疗疾病可能的作用机制,获得与临床疗效密切相关的入血成分作为初步确定的佛手Q-markers。（4）采用HPLC色谱指纹定性与多指标含量测定相结合的方法,对初步确定的佛手Q-markers进行可测性评价,建立主要Q-markers的HPLC含量测定方法,为后续的质量控制研究提供依据。结果:（1）本文从佛手醇提物中鉴定了83个化学成分,覆盖了佛手已知的所有成分类型,包括黄酮类,香豆素类,有机酸类,萜类,氨基酸类和其他化合物,其中16个成分通过与对照品比对而准确鉴定。（2）通过一系列条件考察建立佛手血清药物化学研究方法:确定了佛手样品最佳给药剂量（12.6 g/kg）、采血方式（眼眶后静脉丛取血和腹主动脉取血）、最佳采血点（1 h）、血清样品的制备及预处理方法（甲醇沉淀法）,为后续研究奠定了方法基础。采用UPLC-Q-Orbitrap HRMS技术,通过血清药物化学研究筛查出佛手的入血原型成分26个,主要为黄酮类和香豆素类。（3）网络药理学分析结果表明,佛手可能通过6个入血成分（7-羟基香豆素、异莨菪亭、香叶木苷、橙皮苷、5,7-二甲氧基香豆素、佛手柑内酯）作用于STAT3、AKT1、TNF、PTGS2、ESR1、VEGFA 6个核心靶点,调控PI3K/Akt、MAPK、NF-κB、TNF、VEGF信号通路和雌激素水平,从而参与对细胞因子的反应、细胞凋亡的调控、免疫反应的调节、炎症反应的调节等生物过程发挥促进血管生成、降低机体炎症反应、抑制肿瘤坏死因子、改善免疫系统、提高机体防御能力的作用,从而实现对四种疾病（慢性胃炎、功能性消化不良、消化性溃疡、抑郁症）的临床疗效。在四种疾病治疗过程中均发挥关键作用的6个入血原型成分（7-羟基香豆素、异莨菪亭、香叶木苷、橙皮苷、5,7-二甲氧基香豆素、佛手柑内酯）被初步确定为佛手Q-markers.（4）建立了初步框定的佛手Q-markers的HPLC含量测定方法,方法学结果显示异莨菪亭、7-羟基香豆素、橙皮苷、香叶木苷、5,7-二甲氧基香豆素、佛手柑内酯在0.010～0.051 mg/m L、2.472～12.360 mg/m L、0.827～4.135 mg/m L、1.060～5.300 mg/m L、2.524～12.580 mg/m L、0.635～3.176 mg/m L范围内与各自峰面积积分值呈良好的线性关系;平均回收率分别为:97.48%、98.63%、100.17%、98.25%、98.12%、99.17%,RSD值分别为1.09%、1.22%、2.03%、1.70%、1.25%、1.18%,结果显示六种成分均满足可测性的要求。综上可将与临床疗效密切相关、具有可测性的入血成分7-羟基香豆素、异莨菪亭、橙皮苷、香叶木苷、5,7-二甲氧基香豆素、佛手柑内酯作为佛手Q-markers。结论:本文首先对佛手进行全成分分析和血清药物化学研究以进一步探讨佛手的药效物质基础,继以网络药理学方法研究入血成分发挥临床疗效作用的内在机制,明确了佛手的功效Q-markers,并建立功效Q-markers的HPLC含量测定方法。本文所体现的Q-markers研究方法不但可以建立与佛手药效相关机制明确的中药质量标准,为佛手的后续研究与开发提供依据,而且适用于其他物质基础不明确、作用机制不清楚中药的研究,为类似中药的Q-markers研究提供依据。