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鲇形目(Siluriformes)隶属硬骨鱼纲(Teleostei)、骨鳔鱼类(Ostariophysi)，是一类主要生活在淡水、广泛分布于世界各大洲的鱼类。这个类群在种级和属级水平甚至科级水平的分类都存在争议，有关其系统发育的研究也很贫乏。本研究通过PCR技术获得了鲇形目10科22属32种鱼类线粒体DNA细胞色素b基因1138bp全序列。所得序列与从GenBank下载的分布于非洲、北美洲和南美洲等地的鲇形目鱼类同一基因序列进行排序，并选用脂鲤目(Characiformes)的墨西哥丽脂鲤(Astyanax mexicanus)、断线脂鲤(Phenacogrammus interruptus)，鲤形目(Cypriniformes)的鲤(Cyprinus carpio)以及鲑形目(Salmoniformes)大麻哈鱼属的Oncorhynchus mykiss作外类群。分析了鲇形目鱼类细胞色素b基因序列，计算了Kimura双因子遗传距离，用最大简约法、最大似然法和邻接法构建了鲇形目鱼类分子系统树，得出如下结论： 1．鲇形目鱼类细胞色素b基因序列与脂鲤目、鲤形目和鲑形目鱼类同一基因序列相比存在3bp的缺失。 2．鲇形日鱼类形成一单系群，并且与脂鲤目的关系为近，鲤形目次之。 3．鱼芒科、棘脂鲿科、叉尾鮰科、长臀鮠科、刀鲇科与胡子鲇科在三种方法构建的分子系统树中均结合在一起，形成一大单系群；鲿科均与来自中国的刀鲇科鱼类聚在一起；粒鲇科与钝头跪科也均聚在一起；但鲇科、鮡科和油鲇科的系统发育位置不定。 4．鲿科构成一单系类群，其中蠖属为较为特化的属，拟鲿属为一明显的类群，而黄颡鱼属和鮠属关系较为混乱。