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[目的]探讨TLR9基因启动子区单核苷酸多态性位点(SNPs) rs352139 C>T、rs352140C>T和rs5743836A>G与宫颈癌发生发展的相关性。[方法]根据“知情同意”原则,选取云南地区汉族女性人群中宫颈癌患者253例,癌前病变患者92例,正常健康体检者330例,采用TaqMan探针基因分型的方法对上述SNP位点进行基因分型,并构建单倍型,评估上述3个SNP位点的等位基因、基因型以及单倍型与宫颈癌发生发展的相关性。[结果]1.TLR9 基因启动子区 SNP 位点 rs352139(C>T)、rs352140(C>T)、rs5743836(A>G)的基因型和等位基因在各组间的分布频率差异均无统计学意义(P>0.05)。2.连锁不平衡分析结果显示:在癌症组和对照组中,rs352139 (C>T)与rs5743836 (A>G),rs352140 (C>T)与 rs5743836 (A>G)间存在强连锁,D’值大于0.8。3.根据连锁不平衡结果构建的rs352139 (C>T)、rs352140 (C>T)和rs5743836(A>G)的单倍型在癌症组和对照组中的分布频率差异无统计学意义(P>0.05)。4.对宫颈癌组进行分层分析,研究结果显示TLR9基因rs352139、rs352140和rs5743836位点等位基因、基因型频率在鳞癌组与非鳞癌组、临床Ⅰ期与临床Ⅱ期之间比较无统计学差异,P值>0.05。但是,TLR9基因启动子区rs352139等位基因T的频率在分化好组显著高于分化差组,两组比较差异有统计学意义(P=0.029, OR=0.629 95%CI=[0.414~0.957])。rs352139 位点等位基因 C 的频率在浅肌层组和深肌层组中分布具有显著差异性(P=0.038, χ2=4.299),其中等位基因C的频率在深肌层组明显高于浅肌层组(43.8%、32.7%)。TLR9基因启动子区rs352139位点在有淋巴结转移和无淋巴结转移的比较中,等位基因频率和基因型频率在两组比较中差异有统计学意义(P=0.006和P=0.025),其中C/C基因型频率在无淋巴结转移组明显高于有淋巴结转移组(20.3% vs 4.7%)。[结论]1.在云南汉族女性群体中,TLR9基因启动子区的3个SNP位点rs352139(C>T)、rs352140 (C>T)和rs5743836 (A>G)与宫颈癌的发生发展无相关性。2.TLR9基因启动子区rs352139多态性与宫颈癌和癌前病变无明显相关性,与宫颈癌的病理类型、临床分期无关。但是,T等位基因与宫颈癌组织分化有关,携带T等位基因的宫颈癌患者组织分化更好。同时,T/T基因型频率在浅肌层组占优势,而C/T基因型在深肌层组占优势,表明C/T基因型可能增加宫颈癌深肌层浸润的风险,这也提示C/T基因型可能是宫颈癌进展的危险因素,可为宫颈癌的治疗选择及预后评估提供一定的依据。而在淋巴结转移的比较中,携带T等位基因的宫颈癌患者更容易发生转移,C/C基因型频率在无淋巴结转移组占优势,表明C/C基因型可能减少宫颈癌淋巴结转移的风险,为宫颈癌的治疗选择及预后评估提供了一定的遗传学依据。3.TLR9基因启动子区rs352140多态性与宫颈癌和癌前病变无明显相关性,与宫颈癌的病理类型、临床分期、组织分化程度、肌层浸润深度、淋巴结转移无关。4.TLR9基因启动子区rs5743836多态性与宫颈癌和癌前病变无明显相关性,与宫颈癌的病理类型、临床分期、组织分化程度、肌层浸润深度、淋巴结转移无关。