2008年金融危机的爆发,使我国企业面临严峻的国际经营环境,绍兴纺织业集群中主导企业——华联三鑫、浙江纵横集团、浙江江龙控股集团有限公司等相继倒闭；广东东莞玩具业集群中主导企业——合俊集团的两家下属子公司相继退出；都对其关联企业造成了严重影响,并进而对集群的持续发展造成了巨大威胁。再如,2011年持续的欧债危机等外部环境的恶化,使得温州龙头企业江南皮革、波特曼、三旗集团的相继关停,导致了与其关联的中小企业困境频现等一系列事件,说明企业集群在带来资源整合效应的同时,也存在着生产锁定、财务和信誉危机、技术链间断衰退等负面影响,会导致集群系统封闭和僵化(Markusen,1996)以及整体竞争力的丧失。集群风险作为影响区域经济发展的重要因素,吸引着越来越多的学者关注。但就现有的研究现状而言存在以下主要问题：第一,集群风险的研究仅停留在集群风险产生原因的分析层面,而没有考虑集群风险传导与扩散的内在机理。第二,由于集群网络结构构成关系的复杂性,导致现有研究难以厘清集群风险传导与扩散的内在逻辑关系。第三,由于集群风险演化过程的动态性,导致现有研究很难从定量的角度分析集群网络结构的演化,更无法刻画集群风险传导与扩散的演化特征。针对集群风险研究中存在的问题,本文以现实集群中龙头企业(焦点企业)为研究基点,以焦点企业网络能力为新的视角,以自组织为理论体系,剖析了集群内部网络结构,并借用了复杂网络理论和系统仿真学分析了集群风险未来发展轨迹。在此基础上进一步讨论了集群风险治理和转型升级的路径选择,为集群风险传导与扩散研究供了一个清晰的微观分析框架。在实证分析的脉络中,本文通过三个典型企业集群的现实案例样本,用协同学理论的分析原理进行了探索式多案例的研究设计,构建了集群风险自组织的理论框架。在此基础上,本文调研了167家大型企业的样本,运用结构方程模型验证了相关理论假设,之后运用Netlogo仿真平台再现了三个典型集群实验模型,并对其风险传导与扩散过程进行了实证模拟,从而对集群风险自组织理论假设进行了补充。这在企业集群实证研究中具有一定的创新性和开拓型。通过理论分析和实证探讨,本文主要得出以下研究结论：(1)集群风险自组织是一个内在结构演化的过程,由焦点企业(风险源)网络能力(载体)、网络结构(路径)三者依次作用而阶段性表征,该表征主要体现：集群在层次性、非线性和协同性三者协同演化下,风险阶段性地打破了集群平衡态,从而形成集群风险自组织间断非平衡性的特征。(2)在细分了焦点企业网络能力和网络结构属性的相关维度的基础上,发现：焦点企业网络能力与网络结构(网络中心度、关系适应性)存在着显著的正向关系,而网络结构与集群风险鲁棒性的关系并不是简单的正向或负向的相关关系,而是在一定条件下存在的相互辩证的逻辑关系。(3)集群网络结构与复杂网络模型之间的存在着耦合关系。进一步研究发现：内生性风险和外生性风险影响了集群内企业微观个体及网络关系的变动,使得集群风险鲁棒性具有显著差异；外生性风险下,三类集群风险鲁棒性强弱分布为：中卫型>混合网络型>市场型；内生性风险下,三类集群风险鲁棒性强弱分布为：市场型>混合网络型>中卫型。进而证实了网络结构与集群风险鲁棒性之间的逻辑辩证关系。(4)本文通过企业创业理论,运用了经济学模型及探索式多案例的研究设计,明晰了集群风险治理和集群转型升级的途径。研究发现,在外部风险的作用下,率先进行创业的企业更易成为未来集群内的焦点企业,并迫使其他企业选择跟随战略,实现企业层面的升级,促进集群层面的结构转型；并以此探索了集群跨层面升级原理。以上的研究结论深化了焦点企业网络能力、网络结构、集群风险之间的关系研究,并取得了以下研究进展：(1)从自组织行为的视角,提出了集群风险传导与扩散的理论研究框架,并阐明了其内在机理；(2)从焦点企业网络能力和网络结构属性分析了集群网络构成的复杂关系,在一定程度上厘清了集群风险传导与扩散的内在逻辑关系；(3)从动态演化的视角模拟了集群网络结构的演化过程,深化了集群风险传导与扩散的机理研究；(4)以企业创业理论为基础,初步探索了集群风险治理及升级的路径选择,使得研究具有一定的现实指导意义。