研究背景与目的:肾结石是泌尿外科最常见的疾病之一,其中又以草酸钙结石最为常见。虽然随着内镜技术的发展,肾结石的治疗有了长足的进步,但重复干预的比率很高。肾结石较高的患病率和复发率给患者和社会都带来了巨大的经济负担。肠道菌群已经被证实与多种疾病有关,本研究通过宏基因组测序技术分析草酸钙结石患者与健康人群肠道菌群结构与功能变化。以便找寻肠道菌群参与草酸钙结石形成的证据,为预防和治疗草酸钙结石提供帮助。材料与方法:本研究共搜集40例粪便样本,病例组（RC组）纳入草酸钙结石患者20名,对照组（NC组）纳入健康志愿者20名。采用宏基因组测序方法对病例组和对照组的粪便样本进行检测,对测序结果进行生物信息学分析,包括肠道菌群构成和丰度分析,组间差异物种分析。并通过对KEGG数据库注释,进行差异性功能分析。结果:1.病例组患者肠道菌群Alpha-多样性在Shannon和Simpson水平均低于对照组（P＜0.01）,病例组肠道菌群丰度及多样性均低于对照组。2.在门水平上,病例组和对照组主要以厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门为主。病例组拟杆菌门和变形杆菌门较对照组丰度更高,而对照组厚壁菌门和放线菌门丰度较高。3.PCA分析、PCo A分析和NMDS分析结果均显示两组样本均仅有少量样本重叠,总体上看明显分离开。Anosim分析结果提示组间肠道菌群存在显著差异（P＜0.05）。4.经Lef Se分析,双歧杆菌属、真杆菌属、厚壁菌门、布劳特氏菌属、梭菌属以及部分罗氏菌属、瘤胃球菌属对区分病例组与对照组具有显著贡献度（LDA＞4）。5.PCo A分析结果显示KEGG数据库注释在level 3水平上两组样本有少量重叠,总体上明显分离开。Anosim分析结果提示组间具有显著差异（P＜0.05）。Metastats分析显示半胱氨酸和蛋氨酸的代谢（Cysteine and methionine metabolism）、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成（Phenylalanine,tyrosine and tryptophan biosynthesi s）、淀粉和蔗糖代谢（Starch and sucrose metabolism）等59种代谢通路在组间差异显著（q＜0.05）。结论:1.病例组肠道菌群构成发生了改变,拟杆菌门和变形杆菌门丰度升高,厚壁菌门和放线菌门丰度降低。2.双歧杆菌属、真杆菌属、厚壁菌门、布劳特氏菌属、梭菌属以及罗氏菌属中的s＿＿Roseburia＿intestinalis、s＿＿Roseburia＿inulinivorans、s＿＿Roseburia＿sp＿CAG＿471;瘤胃球菌属中的:s＿＿Ruminococcus＿callidus、s＿＿Ruminococcus＿lactaris、s＿＿Ruminococ cus＿sp＿JC304可能通过影响草酸代谢以及短链脂肪酸的生成参与了草酸钙结石的形成。3.半胱氨酸和蛋氨酸的代谢、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成、淀粉和蔗糖代谢等通路的下调与草酸钙结石的形成有密切关系。