西藏绒山羊IGF-1、FGF5、KAP1.4基因多态性以及mRNA表达分析

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西藏绒山羊的羊绒品质居世界之首,其羊绒的长度、颜色、光泽度以及拉力强度等被人们广泛认可。由于西藏绒山羊的产绒量一直较低,所以提高西藏绒山羊羊绒产量是一个亟待解决的问题。在其他品种的山羊和绵羊的研究中表明IGF-1、FGF5和KAP1.4的基因多态性及mRNA表达水平与毛发生长(羊绒生长)有重要联系,但目前还尚未见该三个基因在西藏绒山羊中的影响的研究报道。鉴于此,试验选择240只来自西藏阿里地区和那曲地区7个县(日土县、措勤县、尼玛县、革吉县、改则县、噶尔县、班戈县)的绒山羊作为研究样本,活体采集耳朵皮肤组织后提取DNA和RNA,从基因多态性和mRNA表达水平两个方面来分析IGF-1、FGF5和KAP1.4是否与西藏绒山羊绒毛产量有联系性。本试验取得的主要研究结果如下:1.西藏绒山羊和其他品种山羊、绵羊FGF5和KA4P1.4基因的序列相似性分别达到了 99.87%和99.84%,IGF-1的相似性较低,为98.36%。通过IGF-1、FGF5和KAP1.4在西藏绒山羊与其他的物种的进化树分析后发现,西藏绒山羊与山羊属、绵羊属之间具有同源性,与家鼠、小鼠、人类的遗传距离较远。2.通过对206只西藏绒山羊IGF-1、FGF5和KAP1.4的测序分析后,发现IGF-1和FGF5没有SNP位点,在对KAP1.4的SNP分析中,发现两个新的SNP位点。其中在209bp位点中,碱基C-T的改变并未导致氨基酸变化,而在245bp的位点中,碱基C-T的改变导致了氨基酸脯氨酸-亮氨酸的改变;同时也对该两个位点的基因型频率和等位基因频率进行统计,发现羊绒产量较高的措勤县绒山羊在两个SNP位点的突变率都是最高的。3.FGF5和KAP1.4mRNA表达水平在羊绒产量不同的7个县的绒山羊之间具有显著差异(p<0.05),其中改则县绒山羊FGF5mRNA表达水平显著性高于日土县绒山羊(p<0.05),措勤县和尼玛县绒山羊KAP1.4mRNA表达水平显著性高于其他 5 个县(p<0.05)。4.IGF-1、FGF5和KAP1.4mRNA表达量水平在不同性别和不同年龄阶段的绒山羊中没有显著性的差异(p>0.05),但IGF-1和KAP1.4都存在mRNA表达量随着年龄增长逐渐增加的趋势。综上所述,试验结果表明:西藏绒山羊与其他品种山羊、绵羊的IGF-1、FGF5、KAP1.4序列的相似性非常高,并且它们之间具有同源性;西藏绒山羊KAP1.4基因中存在两个新的SNP位点,并且该两个位点的突变与能够提高羊绒产量;FGF5和KAP1.4 mRNA表达水平的高低也对西藏绒山羊羊绒产量也具有一定的影响。因此,FGF5、KAP1.4基因可能可以作为西藏绒山羊羊绒生长候选标记基因进行进一步研究。
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