1991年，我国为了适应住房制度的改革需要，解决广大城镇职工的住房问题，上海借鉴了新加坡中央公积金制度的经验，率先在全国建立了住房公积金制度，然后再逐步向全国推广住房公积金制度。一晃住房公积金制度在我国实行了已经有20多年了，住房公积金制度在这20多年期间，也犹如雨后春笋不断发展。住房公积金制度为住房的商品化奠定了坚实基础，为不断提高城镇职工的住房消费能力，促进房地产市场的发展起到了重要的作用，成为推动住房保障制度建设的重要力量。随着我们国家房地产市场的不断发展和持续繁荣，国民对住房的要求越来越高，贷款数量也越来越大，而住房公积金贷款作为政策性贷款更是倍受关注。但是，由于近年来住房公积金贷款规模不断扩大和房地产市场不稳定，住房公积金贷款的风险也是在不断上升，这将影响到住房公积金资金安全，更会危及到我国住房制度改革的成果。因此，如何做好住房公积金贷款的风险防范工作、确保住房公积金资金的安全运行就成了一个需要解决的问题。本文以南通市为例，主要从住房公积金管理中心、借款人以及第三方等几个层面，具体分析了南通市住房公积金的贷款风险问题。在此基础上，提出了加强贷款风险监控、建立贷款风险预警机制的对策建议，以保证南通市住房公积金的安全运行。