原虫是寄生于鸟类的常见寄生虫，不仅危害鸟的生长发育，还对人类健康存在潜在威胁。我国感染鸟类的原虫达70种，其中隐孢子虫、弓形虫、阿米巴、芽囊原虫等可感染人类。上海鸟类资源丰富，仅花鸟市场交易的鸟类接近200种,而有关上海鸟类原虫的调查资料却十分有限。本论文拟通过对上海市部分鸟类原虫感染情况及种类的调查，为做好鸟类原虫病的防控和保护乌类资源提供基础数1.上海部分鸟类寄生虫虫卵检查情况为调查上海市部分鸟类寄生虫感染情况，于2012年2、5、8、11月分别从上海市花鸟市场采集部分鸟类粪便，共采集46种鸟的231个粪样，釆用漂浮法、沉淀法和麦氏虫卵计数法确定其寄生虫虫卵的感染率及感染强度。结果显示：有39种鸟(84.78%)的171个粪样（74.03%)检出寄生虫虫卵阳性，其中5月、11月的检出率均高于2月、8月，粪便中的寄生虫虫卵以球虫卵囊和线虫虫卵为主。每克粪便中的球虫卵囊数（OPG)或线虫虫卵数（EPG)最大值均出现在11月份，分别为168750个和3375个。结果表明，上海市花鸟市场鸟类感染寄生虫的种类较多、感染率高。检查结果为掌握上海市鸟类寄生虫的感染状况和做好寄生虫病的防控提供了基础数据。2.上海部分鸟类血液原虫感染情况调查及种类鉴定为了解上海市部分鸟类血液原虫的感染现状，于2012年1?12月间，采集上海市部分花鸟市场雀形目、鸡形目、鸽形目共计19种76只鸟类的血液样本，采用镜检与分子检测相结合的方式对鸟类疟原虫和血变虫的感染情况进行调杏。结果显示：在鸟类血液样品中，显微镜检出原虫的阳性率只有13.16%(10/76)，而分子检测原虫的检出率达54.05%(40/74);在74只受检鸟中，疟原虫感染率为21.65%(16/74),血变虫感染率为32.43%(24/74)；在灰背鸫血液中鉴定出一鸟类血变虫新种，命名为枢锐血变虫(Haemoproteus shvrii n.sp.)?调查结果表明，上海市鸟类感染血液原虫较为普遍，调査结果为上海市鸟类血液原虫病防治提供了一定依据。3.上海部分鸟类隐孢子虫感染情况调查及种类鉴定为了解上海市部分鸟类隐孢子虫的感染情况,对2012年2、5、8、11月采集的38种177个鸟类粪样,通过分子生物学方法检测鸟类隐孢子虫感染情况。结果显示：有9种22个鸟类样品检测出隐孢子虫,平均阳性率为12.43%,其中原鸽的5个样品全部检出阳性；经序列比对,鉴定出3种隐孢子虫,即贝氏隐孢子虫(Cryptosporidium bailey)、火鸡隐孢子虫(C. meleagridis)、鸡隐孢子虫(Cgalli),鸡隐孢子虫为上海地区首次检出。结果表明,上海市鸟类隐孢子虫的感染率虽不是很高,但存在人畜共患的火鸡隐孢子虫,提示人们在饲养、观赏鸟类时,要切实注意做好相关防范工作。4.上海部分鸟类球虫种类鉴定及环孢子虫调查为了解上海市部分鸟类的球虫种类及环孢子虫的感染情况,从已通过镜检检测为球虫阳性的粪便中筛选13种感染强度较高的鸟类粪便,经培养后对球虫进行形态学观察,最终鉴定为5种球虫,即拉氏艾美耳球虫(Eimeria labbeana)、原鸽艾美耳球虫(Eimeria columbarum)、鹎等孢球虫(Iospora pycnonotae)、拉氏等孢子球虫(Isospora lacazei)、噪鹛等他球虫(Isospora garrulae),并发现1种疑似环孢子虫的卵囊。而后,对2012年2、5、8、11月采集的38种鸟174个粪样进行分子检测。结果显示：有27种鸟114个粪样的分子检测为球虫阳性,未检出环孢子虫；调查结果为鸟类球虫病的防治提供了科学数据。