机器学习与分子动力学模拟在蛋白-蛋白/蛋白-药物相互作用中的应用

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在过去的几十年里,计算模拟和机器学习方法成为研究酶功能和蛋白质-蛋白质相互作用的有力工具。随着计算机和计算软件的发展,研究蛋白质结构、DNA、蛋白质-蛋白质相互作用、酶-底物相互作用等复杂系统的计算能力日益提高。在本论文中,我们使用计算模拟和机器学习方法来探索不同类型的生物系统。第一项研究我们针对幽门螺杆菌Cag A蛋白与肿瘤抑制蛋白ASSP2的相互作用进行药物发现的热点分析。在第二个研究中,我们使用机器学习方法针对脲酶进行活性药物分子分类。在第三项研究中,我们采用分子动力学模拟研究了三个吡嗪酰胺酶
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