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目的：了解乌鲁木齐地区2006年婴幼儿RV的流行病学特征和流行基因型变化，为有效RV疫苗的研制和应用提供参考依据。 方法：自2006.01.01-2006.12.31收集新疆自治区人民医院（XJPH）和乌鲁木齐市儿童医院（XJCH）5岁以下腹泻或非腹泻患儿粪便标本3563份。应用ELISA法检测粪便标本中RV，提取阳性标本RV核酸，应用多重RT-PCR方法进行RV的G型（VP7）和P型（VP4）基因型分型。对部分PCR已分型或未能分型毒株进行VP7和VP4基因测序，并对部分毒株的NSP4基因进行了测序分析。用ClustalXl.83及DNAStar软件比较分析核苷酸序列及其推导的氨基酸序列，分析基因变异情况。用MEGA4.1软件制作系统进化树，分析演化趋势。 结果：乌鲁木齐地区2006年婴幼儿腹泻RV总检出率为38.0％。XJPH产科、新生儿科及儿科不同患儿RV检出率各不相同。产科正常新生儿RV检出率为7.9%，显著低于新生儿科非腹泻（无症状）新生儿的检出率31.0%（P<0.01）。新生儿科腹泻新生儿（≤28天）的检出率(70.5%)和腹泻婴幼儿（>28天）的检出率(65.4%)显著高于非腹泻新生儿（31.0%）和非腹泻婴幼儿（>28天）的检出率（22.5%）（P<0.01）；新生儿科腹泻新生儿与腹泻婴幼儿间、非腹泻新生儿与非腹泻婴幼儿间的检出率差异无显著性（P>0.05）。儿科婴幼儿住院检出率（52.1%）与新生儿科腹泻婴幼儿(65.4%)的检出率无显著差异（P>0.05）。XJPH儿科RV总检出率（53.6%）显著高于XJCH婴幼儿RV检出率（38.4%）（P<0.01）。两家医院儿科住院总检出率（45.2%）显著高于门诊总检出率（37.9%）。总体来说，≤24月龄婴幼儿是RV感染的主要人群；2006年乌鲁木齐地区RV感染的季节高峰在8-10月份；RV腹泻与性别间差异无统计学意义（P>0.05）。RV基因分型结果显示：对于G型而言，XJPH儿科腹泻婴幼儿和XJCH腹泻婴幼儿以G1型为主导优势株，其次流行G3型；XJPH产科正常新生儿、新生儿科腹泻或非腹泻新生儿以及腹泻婴幼儿则主要流行G3型。对于P型而言，XJPH儿科腹泻婴幼儿和XJCH腹泻婴幼儿以P[8]型为主要流行株；XJPH产科、新生儿科腹泻或非腹泻新生儿却主要流行P[6]型；新生儿科腹泻婴幼儿则以P[6]和P[8]型为主，混合感染较多。就RVG/P组合基因型来看，XJPH儿科腹泻婴幼儿和XJCH腹泻婴幼儿主要流行G1P[8]型，其次为G3P[8]；XJPH产科、新生儿科腹泻或非腹泻新生儿及腹泻婴幼儿主要流行G3P[6]型。VP7基因序列分析表明2006年乌鲁木齐地区流行的G3、G1、G9型RV与当时国内及周边国家流行株基本一致，G2型与2001年前后流行株（如J-4709，CH-86）关系近。VP4基因序列分析表明P[6]流行株与新疆XJ05-107株和XJ04-652株进化关系近；P[4]流行株与KO-2核苷酸同源性最高达99.1%-99.5%；P[8]型分别与G3、G1和G9结合，基本分属三个不同的进化支。NSP4基因序列分析表明2006年流行的腹泻或非腹泻G1、G3和G9型毒株均属于NSP4蛋白的B群，流行的腹泻或非腹泻G2型毒株均属于NSP4蛋白的A群。 结论：RV仍然是乌鲁木齐地区婴幼儿腹泻的主要病原，主要感染24月龄以内的婴幼儿。2006年乌鲁木齐RV感染的季节高峰是8-10月。2006年乌鲁木齐婴幼儿（XJPH儿科和XJCH）流行的主要RV基因型是G1P[8]，其次为G3P[8]。XJPH产科存在G3P[6]型RV无症状感染，新生儿科存在院内G3P[6]型RV的感染流行。序列分析表明G3P[6]型RV的流行可能因混合感染基因重配引起，NSP4基因可能与RV毒力无关。