本文使用MP2方法研究了一系列尿嘧啶与胸腺嘧啶二聚体不同位置加水后二聚体间氢键强度的变化。研究结果表明，水加在尿嘧啶或胸腺嘧啶一号位时氢键强度增强，水加在尿嘧啶或胸腺嘧啶二号位时氢键强度减弱。水加在一号位时氢键增强的幅度大于水加在二号位时氢键减弱的幅度。自然键轨道(NBO)分析表明，水加在尿嘧啶或胸腺嘧啶一号位时二聚体间氢键的孤对电子n到反键轨道σ*的二阶相互作用稳定化能增加。水加在尿嘧啶或胸腺嘧啶二号位时二聚体间氢键的孤对电子n到反键轨道σ*的二阶相互作用稳定化能减弱。水加在一号位时二阶相互作用稳定化能增强的幅度大于水加在二号位时二阶相互作用稳定化能减弱的幅度。对于同一二聚体加水后的一系列体系,其氢键键长与其对应的二阶相互作用稳定化能及其对应的电荷转移量之间能呈明显的线性关系。