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可变剪接是高等植物基因转录后表达调控的重要方式之一,在植物发育、逆境适应性等方面扮演着重要角色。目前,可变剪接响应低氮适应性的调节还未得到鉴定。因此,本研究以氮敏感自交系掖478和耐低氮自交系许178为材料,分别于授粉前后进行氮处理,对穗部进行RNA测序与可变剪接分析。通过对不同处理样本的可变剪接生物信息学分析,结论如下:1.内含子保留是玉米穗部可变剪接的主要类型。八种样品中,内含子保留事件所占的比例最高,约为50%-60%。玉米中基因发生内含子保留事件多为一到两次,发生次数越高,所占的比例越少。2.授粉前低氮条件下,许178和掖478分别有20.83%、26.66%的低氮响应内含子保留基因。GO生物过程分类中分别有222、275个基因表现与氮代谢过程有关,196、272个基因表现与生物合成过程有关,146、186个基因与逆境响应有关,此外还有基因与蛋白修饰、形态建成、生殖发育过程有关。授粉后10天低氮条件下,许178和掖478分别有26.17%、25.44%的低氮响应内含子保留基因。GO生物过程分类中分别有255、240个基因表现与氮代谢过程有关,241、224个基因表现与生物合成过程有关,218、177个基因与逆境响应有关,此外还有基因与碳水化合物代谢、蛋白修饰、氨基酸代谢、酯类代谢、转运、催化过程、信号转导、形态建成、胚胎发育、生殖发育过程等有关。从低氮响应内含子保留基因来看,基因表达量差异对其发生内含子保留事件可能没有影响。3.检索到低氮条件下发生内含子保留事件的可变剪接相关基因,如许178中的GRMZM2G060540和GRMZM2G053196;掖478中的GRMZM2G130207、GRMZM2G044306、GRMZM2G320920。对不同的材料而言,相同处理条件下预测的motif相似度高度一致。八种样品中发生内含子保留事件的GC含量普遍偏高,而长度分布均集中在较小的长度。八种样品中内含子保留的发生均造成提前终止密码子(PTC:premature termination codon)的形成,且含有提前终止密码子转录本比率处于92%左右。