清末民初,晚清政府和民国政府为摆脱财政困境不断开辟新税源,以农业税为主的传统赋税结构开始向以工商业税为主的近代税制结构转型。随着税制结构的转型,专门性的税收机构开始出现,北洋政府设置烟酒税和矿税机构。南京国民政府在税制改革的过程中进一步整顿货物税机构,使货物税收入不断增长,货物税在国税中的地位得到提高。货物税在国税地位的提高引起南京国民政府对货物税的重视,南京国民政府为了提高货物税的征管效率以及减少征收成本,将统税署与印花烟酒税处合并为税务署。税务署成立后,不断扩大统税的征收对象并将矿产税纳入货物税体系之中,以统税、烟酒税和矿产税为主体的货物税体系逐步形成。在组织机构的建设过程中,税务署不断完善中央层面的组织架构和统一地方货物税机构。抗战后期地方直货税机构的分合与抗战胜利后税务署与直接税署的裁并,使南京国民政府的税务行政机构趋于统一,税务行政效率不断提高。税务署的成立标志着货物税的征收进入统征时期。税务署在人事管理方面注重税务人员的培训与用人唯贤唯才,并从制定税收激励办法、提高薪俸福利待遇方面激发税务人员的工作热情。税务署的税收管理包括征收、查验与督察。首先,在征收方式上,税务署不断完善统税的驻征制度,并将统税的课征原则运用到烟酒税、矿产税的征收过程之中。烟酒税的包商制被废除,代之于多元化的征收方式;其次,在查验方面,税务署通过设置查验机构,分区派遣查验人员,以及与其他部门的合作来加强货物税的查验力度;最后,税务署通过设置督察机构,推行旺季督征以及分区派遣督察人员进行巡回督察来监督各地的税务情况。尽管税务署通过完善具体的税收管理工作,保证国库的收入与巩固以货物税为主体的间接税在税收结构中的地位,但是其在执行赋税政策时不能很好地兼顾工商团体的利益,使得两者具备合作与冲突的关系。