基于微流控数字化等温扩增的单细胞核酸分析研究

来源 :华中科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangxingchuang
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基于核酸扩增的分子诊断技术在重大传染性疫情防治、癌症筛查、遗传性疾病诊断等领域发挥着重要的作用。常规的核酸检测方法为聚合酶链式反应,该技术检测时间长、精准的温度控制且需特殊仪器及专业技术人员操作。为解决传统扩增检测中存在的不足与问题,本文基于微流控技术,利用环介导等温扩增方法对非小细胞肺癌细胞的常见突变位点进行特异性检测。论文的主要研究内容如下:建立了一种基于dLAMP的微流控数字化核酸检测平台,并将其成功应用于非小细胞肺癌细胞NCI-H1975的突变筛查。首先基于软光刻技术,设计含有多个平行阵列的微流控芯片,通过PDMS改性及负压处理,实现了样本和试剂100%的进样量及快速载入。“三明治”结构的设计减少了扩增过程中试剂的蒸发。其次,优化了影响LAMP反应的各因素,比如甜菜碱、引物浓度、染料浓度等,在其最佳反应条件下,成功实现了NCI-H1975突变位点的特异性筛查,检测限为单个细胞拷贝数。最后利用该芯片与q PCR技术对未知样本测试并进行结果比较,检测灵敏度更高。建立了一种基于dLAMP的数字化单细胞阵列核酸分析平台。采用亲疏水微阵列通过限制性稀释的方法构建数字化单细胞阵列,并对形成的单细胞阵列进行了验证和评价,进一步优化了影响LAMP扩增的各因素,成功实现了对不同混合比例的MC38和NCI-H1975细胞样本中EGFR L858R突变基因的特异性筛查。为了提高该方法的稳定性与重现性,本文进一步提出2种单细胞阵列的构建方法:一种是基于细胞尺寸捕获的SU-8微井阵列,该方法单细胞捕获效率高达62.15%,重复性好,但扩增体系太小无法进行后续的扩增反应;另一种是基于液滴大小的双层捕获阵列,分别通过下层微井结构捕获单细胞,上层“倒八”结构捕获大液滴,扩大了反应体系且液滴捕获率接近100%。本文对三种形成数字化单细胞阵列的方法进行了比较分析,为进一步单细胞核酸检测奠定基础。
其他文献
富源酸菜是云南省富源县常见的一种酸菜,以萝卜、新鲜青菜、玉米面和水为原料,不添加其他原料,经自然发酵等工艺制成的食品。富源酸菜主要以家庭小作坊为主,参与发酵的菌株比较复杂。微生物多样性分析有利于分析菌落组成,分离优势菌株可作为菌种发酵剂,进行可控化生产。本文采用高通量测序技术结合平板菌落计数法,检测分析富源酸菜酸水中的细菌多样性;使用MRS培养基分离酸水中乳酸菌,通过形态观察、定性试验、耐酸性、耐
介绍了一种采用半自动TIG焊机焊接船用锅炉管板的焊接工艺,通过此种焊接工艺方法能获得高质量的焊接接头,并且能极大地提高管板的焊接效率。
<正>文体教学是语文教学绕不开的话题,不同文体应有不同的教学方法,但不等于说,一篇课文一定要根据该篇的文体来教。《中学语文教学参考(中旬)》2020年第4期刊出花玉娟老师《<陋室铭>就该当"铭"来教》一文,文章提出"把《陋室铭》当‘铭’来教"。笔者以为,这种提法值得商榷。一、《陋室铭》之"铭"《陋室铭》大约写于824—826年,是刘禹锡在"永贞革新"失败后被贬至安徽和州县,又屡遭刁难的背景下愤而所
期刊
<正>近年来,基于学科素养提升的大单元教学设计成为“新课改”背景下的热门话题,新的课程方案和课程标准进一步强化了学科的育人功能,是学科育人价值的集中体现,强调了学科在贯彻党的教育方针、落实立德树人根本任务中的重要角色。学生通过学科学习逐步形成的关键能力、必备品格与价值观念并不是二维知识的集合,而是具有整体性、情境性、实践性和反思性的综合素养的体现,应当引导学生在真实情境中运用所学知识解决问题,而不
期刊
报纸
在保证高速公路改扩建施工进度的前提下,为最大程度降低对改扩建公路及周边区域交通的影响,以高速公路“四改八”工程为例,对改扩建施工期较复杂的互通式立交的交通组织进行了研究。在结合相关标准、规范对高速公路改扩建互通式立交施工期保通要求进行分析的基础上,重点对高速公路互通式立交改扩建施工期分流和保通两种交通组织模式进行了方案研究。分流方案以深圳市某条高速公路改扩建为例进行说明;保通设计研究为便于说明和理
国家心血管病专家委员会微创心血管外科专业委员会(Committee of Minimally Invasive Cardiovascular Surgery,CMICS)每年会对上年度全国各单位心血管外科开展的微创心血管外科手术情况进行调查,按照微创手术量、地区及医院分布情况进行分类汇总,并在中国微创心血管外科大会主题报告上公布。2021年CMICS首次以白皮书形式在《中国胸心血管外科临床杂志》上
<正>教学是一门科学,更是一门艺术。我认为易志军老师的《陌生:阅读教学新思维》一书谈的就是教学艺术,谈的就是如何优化教学策略。书中提倡的"陌生化教学"没有它的名字那么玄乎,从教学观念上说,它是一种对教学策略的创新,从教学手段上说可能是换一种提问的方式,换一个切入的视角,换一种出示的方式……以这种"新"去调动学生的学习热情,提高教学效率。易老师在书中通过一个个生
期刊
针对农村生活污水处理的高效率、低能耗等要求,分别通过集成式气提装置、集成水泵及气泵2种方式,将传统SBR工艺进行改进,应用于农村生活污水处理,并考察了其对污染物的去除效能。结果表明,在处理量不超过1.0m3/d的条件下,2种改良SBR工艺均可实现农村生活污水的高效处理,处理后出水氨氮、总氮及总磷等指标能够稳定达到四川省《农村生活污水处理设施水污染物排放标准》(DB 51/2626-2019)的一级