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黄瓜是研究植物性别表达的经典材料，其性别表达除了受遗传因子控制外，还易受环境和化学物质的调控。长日照、高温、GA促进雄花产生，而短日照、低温、乙烯则促进雌花形成。内源乙烯因与黄瓜雌花的形成呈显著正相关，被称为黄瓜植株的“性激素”。研究表明，乙烯不敏感转录调节基因(ethylene insensitive3，EIN3)是定位在细胞核上的乙烯信号转导下游元件，其编码的EIN3蛋白与乙烯反应相关基因启动子的特殊序列结合，激活这些基因的转录。立足于此，本研究以一对近等基因系黄瓜材料W11983G(全雌株)和W11983H(两性花株)及其F2群体为材料，分别进行了关于EIN3基因的SNP标记筛选与分析、利用RFLP-Bfm I技术阐明黄瓜性别表达机理、全基因组DNA多态性片段筛选等研究，结果分述如下：
(1)通过对W11983G和W11983H的EIN3基因序列分析，获得两个SNP标记。根据两个变异SNPs重新设计引物组I(Forward primer：5’-cat gat ggg atcttgaag-3’和Reverse primer：5’-cac cat tcc tcg act cca-3’)和引物组Ⅱ(Forwardprimer：5’-cat gat ggg atc ttg aag-3’和Reverse primer：5-ata ata gca age caggta gc-3’)。通过特定PCR扩增，发现只有性状为全雌性的植株才可获得特异性产物，其中引物组Ⅰ扩增得到的特异性片段大小为382bp左右，引物组Ⅱ则为605bp左右。田间性别统计表明，全雌性相对于两性花基本符合3:1的分离规律(x<2><0.05)，按照Yin和Quinn的模型，初步推测全雌株的基因型为FFMM，而两性花株的基因型则为FFmm。上述两个标记有望作为黄瓜雌性株系的分子标记进行辅助选择。
(2)利甩RFLP-Bfm Ⅰ技术对W11983G和wIl983H的EIN3基因序列进行进一步分析，发现性别为两性花的黄瓜植株，产物均为500 bp大小的酶切产物(aa)；而性别为全雌性的黄瓜植株，分为两种情况，一种为产物包括497 bp和608 bp的两条主带(Aa)，另一种为608 bp的主带(AA)。田间统计表明，AA:Aa:aa比例接近1:2:1(x<2><0.05)。这进一步证实了w11983G的基因型符合FFMM，而W11983H则符合FFmm的特征，杂交后其F2群体的性别因M/m分离而发生分离。
(3)利用RAPD技术筛选了600多条随机引物，未获得任何差异片段；通过AFLP分析，获得了5条可进行回收克隆的特异性条带，分别为：CT TG480bp和CA_AT<,500>bp、CA_AT<,520>br.、CA_AT<,680>bp、CA_AT<,700>bp，为进一步寻找控制黄瓜性别决定的基因提供了丰富的实验基础。