本研究以华南农业大学甜玉米课题组培育的114个稳定的甜玉米自交系和5个普通玉米自交系的代表系为材料，利用SSR分子标记技术，对其种质遗传多样性及杂种优势类群划分进行研究；并比较了SSR分子标记与特殊配合力划分12个常用甜玉米自交系的分类结果的一致性，主要结果如下： 1.利用SSR分子标记所得的遗传相似系数将119份自交系划分为六个类群，聚类结果与己知系谱基本一致。同时本研究还将一些地方种质和系谱不明的自交系划入到相应的优势类群中。聚类后，群间的平均遗传相似系数都小于群内平均遗传相似系数。表明SSR分子标记可以有效的把甜玉米自交系遗传多样性分开。其分类结果是合理的。 2.利用SSR分子标记对12个常用的甜玉米自交系进行杂种优势群划分，同时比较根据产量特殊配合力划分类群的结果。分类结果显示产量特殊配合力划分类群结果和分子标记划分的基本一致，说明可以用SSR分子标记划分甜玉米自交系杂种优势群。 3.在进行遗传多样性分析时，可以选择前人研究得出的遗传多态性高的、扩增稳定的引物，对供试材料进行分析，从而减少引物选择的盲目性，提高试验的效率。本研究发现，在普通玉米中多数PIC值高的SSR引物在甜玉米也能表现出好的多态性，个别SSR引物例外。可以参考普通玉米SSR引物选择甜玉米SSR引物。 4.选择遗传多态性高的SSR引物组成核心引物，可以快速、有效地对供试材料进行遗传差异分析。本研究发现，bnlg391、Phi002、Phi011、Phi019、phi024、Phi028、Phi048、Phi064、Phi073、Phi076、Phi112、Phi127、Phi128、Umc1109、Umc1124这15对引物的扩增产物重复性好、稳定的带型，而且PIC值较高，分类结果较好，可以作为核心引物对甜玉米自交系进行快速分类。 总的来说，利用SSR标记划分甜玉米杂种优势群是行之有效的，划分结果与系谱资料基本一致，并且可以将系谱来源不清的种质划分到相应的杂种优势群。然而杂种优势群的划分面对的是复杂的产量性状和品质性状，SSR标记划分甜玉米杂种优势群还需要与数量遗传学分析以及大田种植的实践经验相结合，才能划分出更加合理、适用的甜玉米种质杂种优势群。