我国经济发展存在的区域分化格局，阻碍了要素在城市之间的集聚，导致创新效率呈现出明显的区域失衡和空间差异现象。东部地区城市规模分布不断优化，大量人才、资金以及技术等创新要素不断集聚，使之成为具有很强创新活力的城市集体，有力地推动了经济社会发展。但与之相对的是，中西部地区发展相对滞后，区域内部城市化进程不均衡，导致创新要素在城市之间难以有效集聚，阻碍区域空间功能分工的形成，使得创新主体的发展并不理想。城市规模分布作为城市化进程的结果，其经济活动集聚的演化会影响区域间要素的集聚关系，进而影响区域创新效率的提升。
　　基于以上认识，本文围绕“文献整理——理论构建——实证检验——政策建议”的研究思路进行展开。首先对已有关于区域创新系统、区域创新效率以及基于集聚效应的城市规模与创新效率的相关研究文献进行梳理，然后厘清城市规模分布与区域创新效率两者间的理论逻辑，分析连接城市规模分布与区域创新效率的内在运行机制，随后构建城市规模分布影响区域创新效率的计量模型，对本文提出的命题进行实证检验，识别城市规模分布对区域创新效率的影响关系，最终形成提升我国区域创新发展的政策建议。
　　本文最大的创新之处在于将城市规模分布纳入区域创新效率的影响分析之中，得到如下有价值的结论。研究证实：（1）我国区域创新效率值低于1，说明技术非效率因素明显存在，且地区不均衡和空间差异显著。对地区进行聚类分析后形成新型东中西部划分，发现我国各省域的创新发展与经济发展存在一定差异。（2）对全国来说城市规模分布与区域创新效率呈显著的倒U型关系，U型曲线最高点对应的最优首位城市集中度为0.353；东部地区城市规模分布与区域创新效率仅成负相关关系，而中部地区和西部地区城市规模分布与区域创新效率呈显著的倒 U型关系，U型曲线最高点对应的最优首位城市集中度分别为0.355和0.378。
　　据此，本文提出优化城市规模分布的关键：一方面在于疏通区域创新发展过程中极化效应和扩散效应的通道，打破干预创新要素自由流动的壁垒；另一方面在于深化区域空间功能分工，打造地区空间集聚的层次与差异。最终有效发挥创新要素的集聚效率，实现区域创新的优化提升。