党的十八大向全党和全国人民发出了“坚定不移沿着中国特色社会主义道路前进，为全面建成小康社会而奋斗”的行动纲领和政治宣言，对新时期的审计工作提出了新的要求，特别是内部审计工作，要坚持、完善中国特色社会主义审计制度，坚定不移的贯彻执行中央的决策和部署，进一步牢固树立科学审计理念，增强审计转型的紧迫感、责任感和使命感。早在党的十七大会议上就已经明确要求建设服务型政府，完善行政事业单位的内部机构设置，决策、执行、监督职能要相对分离、相互制约。在这样的背景之下，有必要完善行政事业单位内部机构设置，完善内部职能，形成相互监督与制约的平衡状态，从而促进行政事业单位更好的履行公共职能。而内部审计作为一种有效的监督与控制手段，既顺应了时代与发展的要求，同时也能够更好的帮助行政事业单位完成使命与建设工作。因此，针对行政事业单位内部审计展开研究是十分有必要的，一方面能够为行政事业单位的公共职能发挥提供重要的保障，另一方面也有利于内部审计监督、制约作用与职能的发挥。首先采用文献资料法，通过对相关文献资料的搜集、分析和整理，对行政事业单位内部审计的概念以及理论基础进行概述，为研究奠定必要的理论基础；其次，采用实践分析法，通过调研部分行政事业单位查找实例的方式，结合行政事业单位内部审计工作开展现状进行分析，深入剖析行政事业单位内部审计工作中存在的问题与不足；再次就存在问题与不足的根源进行深刻的咨询、分析和研究，为对策与建议的提出提供重要的依据；最后，在分析的基础之上，采用理论结合实践法，对我国行政事业内部审计工作进一步完善提出建议。通过此研究，一方面能够从理论的角度上丰富学术界对行政事业单位内部审计工作研究的内容，另一方面也能够为我国行政事业单位内部审计工作的完善提供实践指导与参考。