苯丙氨酸羟化酶基因大片段缺失的基因分型研究

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高苯丙氨酸血症(hyperphenylalaninemia,HPA)是我国发病率较高的一种常染色体隐性遗传病,分为PAH(phenylalanine hydroxylase)缺乏症和BH4(tetrahydrobiopterin)缺乏症。PAH缺乏症主要是由于编码苯丙氨酸羟化酶的基因发生突变,导致PAH蛋白结构发生变化,影响其活性甚至失活。苯丙氨酸(Phe)不能按正常的代谢途径代谢,在体内堆积或经旁路代谢,导致一系列临床症状发生。PAH缺乏症是一种可以通过饮食治疗的遗传代谢病,确诊和治疗的时间越早,患者的智力越接近正常水平。在不同人群和不同地域,HPA的发病率差异较大,在我国的发病率约为1:10,397。目前全世界已报道有1000余种PAH基因突变类型,大部分突变类型为错义突变,但仍有约5%的PAH基因大片段缺失无法通过常规测序方法检出。本论文的研究对象是PAH基因大片段缺失,分析我国PAH基因大片段缺失的热点突变类型,建立一种快速、准确检测中国人群PAH基因大片段缺失的新方法,并通过临床标本验证该方法的准确性和可行性。第一章,首先简要概述了 PAH缺乏症的发病机制和临床症状,然后系统介绍了目前PAH缺乏症筛查和诊断所用的方法和PAH缺乏症的治疗方案,PAH基因大片段缺失在不同地区、不同人群中出现的类型和频率,以及常用的PAH基因大片缺失常用的检测方法。在最后,列出本论文的目的、内容及意义。第二章,首先采用Gap-PCR结合测序方法鉴定了PAH基因Ex47del的断裂位点,并对本实验室检测到的所有缺失类型进行统计分析,共获得39位PAH缺乏症患者携带PAH基因大片段缺失,共计41个缺失等位基因。其中Exlde13.7kb(36.59%,15/41)、Ex6de17793(26.83%,11/41)、Ex45de116271(19.51%,8/41)为我国PAH基因大片段缺失的热点突变类型,Ex4de111612、Exldel5.3kb、Ex5de17750为中国人群特有的缺失类型。第三章,以PAH基因大片段缺失基因分型为研究对象,将多重媒介探针熔解曲线分析技术应用于PAH基因大片段缺失的检测。本章成功建立了一管四色二十重的检测体系,实现了同时对中国人群常见的10种PAH基因大片段缺失类型进行基因分型,并使用质粒标准品和临床标本对体系的稳定性、重复性、灵敏度和准确性进行考察。结果表明,本章所建立的大片段缺失基因分型体系的灵敏度可达到50 pg/reaction人类基因组DNA。此外,本体系还对222份临床标本进行检测,基因分型结果与MLPA检测结果相比,多检出2份标本中存在PAH基因大片段缺失,并且所有的检测结果均经过测序验证成功。该基因分型体系简便快速、结果准确且可筛查新生儿血斑等低浓度基因组DNA模板,适用于我国PAH缺乏症基因大片段缺失突变的大规模筛查。
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