紫贻贝对厚壳贻贝遗传渐渗研究及两者16SrRNA序列比较分析

来源 :上海水产大学 上海海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chl1220
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贻贝是重要的经济贝类之一。厚壳贻贝是我国的南方品种,1973年,紫贻贝从北方移植到浙江嵊泗厚壳贻贝养殖海区进行养殖,最近几年出现了外形上有别于厚壳贻贝与紫贻贝的个体,本研究从形态与分子生物学方面对我国浙江嵊泗厚壳贻贝、紫贻贝养殖群体遗传渐渗进行了研究。 运用聚类分析、主成分分析和判别分析三种多元分析方法,采用10个形态比例性状,对紫贻贝、厚壳贻贝遗传渐渗的形态表现进行研究。从外观上看,杂交贻贝介于紫贻贝与厚壳贻贝之间。聚类分析结果表明,杂交贻贝与厚壳贻贝的形态相近。主成分分析的结果表明,杂交贻贝的形态受厚壳贻贝与紫贻贝的共同影响,杂交贻贝的形态与厚壳贻贝比较接近。判别分析表明,杂交贻贝、厚壳贻贝与紫贻贝三种贻贝的形态差异显著(P<0.01)。判别准确率P1为91.42~93.85%,P2为78.05~98.39%。判别效果依次为紫贻贝>厚壳贻贝>杂交贻贝,平均拟合概率为92.77%。从上述分析可以看出,杂交贻贝是另外一个种,是厚壳贻贝与紫贻贝的杂交种,也就是厚壳贻贝与紫贻贝之间发生了渐渗现象。也用逐步判别筛选出的5个形态参数建立了区分紫贻贝、厚壳贻贝和杂交贻贝的判别函数。 运用ISSR标记对紫贻贝、厚壳贻贝遗传渐渗进行研究。取外套膜组织,以酚-仿抽提方法提取DNA,利用筛选获得的12条ISSR引物进行PCR扩增,反应产物经2%的琼脂糖凝胶电泳分离、EB染色,运用Popgene软件对电泳结果进行分析。结果表明,厚壳贻贝与紫贻贝的特异性标记在杂交贻贝中有所反应,进一步证实了厚壳贻贝与紫贻贝发生了杂交和基因渐渗现象。在杂交群体中主要以回交个体的为主,回交个体占65%。目前由于人工捕捞、环境改变以及外来种的引进的影响,要求我们对厚壳贻贝的种质资源进行保护。 对厚壳贻贝、紫贻贝线粒体DNA16SrRNA基因片段进行了扩增和测序,得到了315bp的碱基序列,并对其进行分析,结果显示:厚壳贻贝、紫贻贝线粒体DNA16SrRNA基因片段的碱基组成分别为,30.9%(T)、14.2%(C)、32.0%(A)、22.9%(G)和31.3%(T)、15.4%(C)、30.8%(A)、22.5%(G),其A+T含量为61.9~63.2%。两种内各个个体间的平均核苷酸序列的变异率为0.0254和0.0381,其中厚壳贻贝有1个碱基变异为转换;有3个颠换,其中以GT颠换为主,另外还有3个缺失或插入位点。它们的转换比颠换值为0.4;而紫贻贝有6个碱基变异为转换,其中AG和TC之间的转换数分别为4个和2个;有3个发生了TG颠换,另外还有2个缺失或插入位点。它们的转换比颠换值为2.0。它们的同源性为87.24%,种间差异显著。
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