生态危机的出现和生态文明的倡导使专利制度和环境保护两个原本相互独立的制度发生了遇合,专利制度的生态化成为其契合点。专利制度应该在保护专利权的同时考量环境伦理,以防止因专利权的滥用而引发生态危机。这需要在公共利益原则及可持续发展原则的引导下调试专利制度,以期其对发明人的创新自由予以适度限制。专利制度生态化有其深刻的伦理基础、经济基础和法理基础。现行专利制度具有生态两重性,生态正效应表现为替代、导向和激励等功能;生态负效应表现为引发环境污染、破坏生物多样性及阻滞生态技术的移转与扩散等后果。国际社会正在为充分发挥专利生态生效应功能的同时,抑制其负效应的进一步扩张而不断努力。国际公约及外国法已有将生态因素纳入专利制度的尝试,国外学者亦有呼吁专利制度生态化的理论著述,但在目前经济发展这一主导力量的牵引下,以上努力显得仍然薄弱。专利制度对我国来说舶来未久,要求其生态转向更显得超乎所能,但在建设生态文明社会及贯彻落实科学发展观的背景下,专利制度的生态化凸显其必要性。前述专利制度生态化的尝试,为我们提供了制度构建的路径指引。应从确立环境友好理念、专利客体制度、专利实施前风险评估制度、专利审查申请制度及专利强制许可制度等方面对专利制度进行生态化重构,以促进生态文明建设。专利制度生态化的设置,并非要以牺牲经济发展为代价来谋求生态平衡,相反,其体现了现代社会中公权对私权的介入和渗透,体现了环境因素对技术发展异化的规制和监管,是实现科学发展观的重要保证。