基于基因组和蛋白组序列特征的嗜盐古菌(盐杆菌科)耐辐射机制的研究

来源 :浙江大学生命科学学院 浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:leave2009418
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本文通过研究盐杆菌科(或嗜盐菌科,Halobacteriaceae)中的Halobacterium sp.NRC-1和其他成员的基因组双核苷酸组成、蛋白质组氨基酸组成,以及四核苷酸分布,从多个角度整合分析了盐杆菌科的紫外线辐射耐受性机制。数据表明,嗜盐古菌中较低的相邻双嘧啶核苷酸的使用频率有利于其在基因组水平上降低形成光产物的可能性。另一方面,所有易受活性氧自由基攻击的氨基酸残基在嗜盐古菌的蛋白质组中的使用频率也显著减少了;这些氨基酸较低的使用频率可以帮助嗜盐古菌降低辐射对蛋白质造成的伤害。之后,我们将zim的表达和基因组结构联系起来,重新研究了前人推测的错配修复通路的重要性。 我们的研究结果表明,由于Halobacterium sp.NRC-1和其他极端嗜盐古菌(Haloarcula marismortui, Haloquadratum walsbyi)的生存环境中经常存在着高水平的紫外线辐射,这些微生物在进化的历程中已经优化了自己的基因组和蛋白质组的组成结构以便在不同的水平上降低UV辐射造成损伤的可能性。
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